RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545688.5

SNHG1-224, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 3

Gene SNHG1, Length 610 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-224	ENST00000545688	FBXO43	Q4G163	708 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	GJB7	Q6PEY0	223 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	MASTL	Q96GX5	879 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	SLC39A13	Q96H72	371 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	ADGRG7	Q96K78	797 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	PKP4	Q99569	1192 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	LINC01565	O15544	149 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	SLC25A17	O43808	307 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	FAM155B	O75949	473 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	DAO	P14920	347 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	CTPS1	P17812	591 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	CYP4A11	Q02928	519 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	SLC18A2	Q05940	514 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	FAM27E3	Q08E93	113 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	MYBPH	Q13203	477 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	CAPS	Q13938	189 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	UBE4A	Q14139	1066 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	LPIN1	Q14693	890 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	BRD3	Q15059	726 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	GHDC	Q8N2G8	530 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	THAP4	Q8WY91	577 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688		A0A0U1RQJ8	604 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	STX16	O14662	325 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	BUB3	O43684	328 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	ADA	P00813	363 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	SERPINC1	P01008	464 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	ADD2	P35612	726 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63	5e-21	■□□□□ 9.8
SNHG1-224	ENST00000545688	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	SNTA1	Q13424	505 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	MON1A	Q86VX9	555 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	ZNF114	Q8NC26	417 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	RNFT2	Q96EX2	444 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	MALT1	Q9UDY8	824 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	CD207	Q9UJ71	328 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688		J3KR12	359 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	CH25H	O95992	272 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	TK1	P04183	234 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	TNNT1	P13805	278 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	HNF1B	P35680	557 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	ARSF	P54793	590 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	DDR1	Q08345	913 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	XKR9	Q5GH70	373 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	PGBD5	Q8N414	524 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	DERA	Q9Y315	318 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	KRT36	O76013	467 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	GAS8-AS1	O95177	125 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	MYF6	P23409	242 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	FMO4	P31512	558 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	CHKA	P35790	457 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	CENPA	P49450	140 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	ST3GAL1	Q11201	340 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	POSTN	Q15063	836 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	DCAF6	Q58WW2	860 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	AFG1L	Q8WV93	481 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	TRIB2	Q92519	343 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	RILPL2	Q969X0	211 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	RNF183	Q96D59	192 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	YME1L1	Q96TA2	773 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-224	ENST00000545688	DONSON	Q9NYP3	566 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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