RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	DCC	P43146	1447 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	MAP3K1	Q13233	1512 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	PIK3C2B	O00750	1634 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	LRP6	O75581	1613 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	CEP152	O94986	1710 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	TACC1	O75410	805 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	ESRRB	O95718	433 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	TTLL1	O95922	423 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	MT-CO3	P00414	261 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	IL11	P20809	199 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	GSTM2	P28161	218 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	IDUA	P35475	653 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	CPOX	P36551	454 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	MPL	P40238	635 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	PSMC6	P62333	389 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	RFX6	Q8HWS3	928 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	FRMD1	Q8N878	549 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	TERB1	Q8NA31	727 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	SCFD2	Q8WU76	684 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	HSPH1	Q92598	858 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	CALML4	Q96GE6	196 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	WDFY2	Q96P53	400 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF347	Q96SE7	839 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308		Q9N2J8	555 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	ARL15	Q9NXU5	204 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	EP400	Q96L91	3159 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	RGS12	O14924	1447 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	PTCH1	Q13635	1447 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	CHD4	Q14839	1912 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A1W2PQF6	199 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A1W2PRQ8	180 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	EXOC3	O60645	756 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	USP12	O75317	370 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	TSPAN9	O75954	239 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	BEST1	O76090	585 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	OR2C1	O95371	312 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	GALT	P07902	379 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	GLUL	P15104	373 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	TGM2	P21980	687 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	PLA2G5	P39877	138 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	PSMB10	P40306	273 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	CCT8	P50990	548 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	SNX16	P57768	344 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	OLR1	P78380	273 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	EPS8	Q12929	822 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC14A1	Q13336	389 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	IRF3	Q14653	427 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	KCNB1	Q14721	858 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	AWAT1	Q58HT5	328 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	RRM2B	Q7LG56	351 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	NEK8	Q86SG6	692 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SNHG1-222	ENST00000545308	CPXM2	Q8N436	756 aa		4.34	□□□□□ -1.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms