RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532226.1

TRAF3IP2-AS1-209, TRAF3IP2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAF3IP2-AS1, Length 2,191 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 SEMA4AQ9H3S1 761 aa8.31□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 PDFQ9HBH1 243 aa8.31□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 FSCN3Q9NQT6 498 aa8.31□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 DYRK4Q9NR20 520 aa8.31□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 DTLQ9NZJ0 730 aa8.31□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 GMEB2Q9UKD1 530 aa8.31□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 WASF2Q9Y6W5 498 aa8.31□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 CHD5Q8TDI0 1954 aa8.3□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 BTNL10A8MVZ5 291 aa8.3□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 PROB1E7EW31 1015 aa8.3□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa8.3□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 KCNK1O00180 336 aa8.3□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 APOL1O14791 398 aa8.3□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 RHOBTB1O94844 696 aa8.3□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 SEMA4FO95754 770 aa8.3□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 ADH1BP00325 375 aa8.3□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 C5AR1P21730 350 aa8.3□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 GARSP41250 739 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 CDKN2BP42772 138 aa8.3□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 SEMG2Q02383 582 aa8.3□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 AP1B1Q10567 949 aa8.3□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 LBRQ14739 615 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 MYLK3Q32MK0 819 aa8.3□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 LRRC38Q5VT99 294 aa8.3□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa8.3□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 KIAA2013Q8IYS2 634 aa8.3□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 TXLNBQ8N3L3 684 aa8.3□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 LRRC57Q8N9N7 239 aa8.3□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 RUBCNQ92622 972 aa8.3□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 ALG3Q92685 438 aa8.3□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 KLHL32Q96NJ5 620 aa8.3□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 CEP44Q9C0F1 390 aa8.3□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 KCNF1Q9H3M0 494 aa8.3□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 SEPT10Q9P0V9 454 aa8.3□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 PRDM4Q9UKN5 801 aa8.3□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 AMFRQ9UKV5 643 aa8.3□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa8.3□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 DOCK9Q9BZ29 2069 aa8.3□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa8.3□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 GOLGA8CPA6NN73 597 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 MEI4A8MW99 385 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 NEBLO76041 1014 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 PRNPP04156 253 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 ITIH2P19823 946 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 ZBTB16Q05516 673 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 IL10RBQ08334 325 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 ZNF235Q14590 738 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 TFDP3Q5H9I0 405 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 MARC1Q5VT66 337 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 DCAF12L1Q5VU92 463 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 FAM46CQ5VWP2 391 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 LYSMD4Q5XG99 296 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 FBXL19Q6PCT2 694 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 SLC36A4Q6YBV0 504 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 TTC7BQ86TV6 843 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 NT5DC3Q86UY8 548 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 CAMK1DQ8IU85 385 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 NSMCE1Q8WV22 266 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 KLK6Q92876 244 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 ARRDC3Q96B67 414 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 BIRC7Q96CA5 298 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 FAF2Q96CS3 445 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 C10orf88Q9H8K7 445 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 FBRSQ9HAH7 460 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 NT5MQ9NPB1 228 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 A8MX80 341 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 PCDH8O95206 1070 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 POP4O95707 220 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 IGSF6O95976 241 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 PRKCGP05129 697 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 CFIP05156 583 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 RETP07949 1114 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 PYGMP11217 842 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 MPLP40238 635 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 ADPRHP54922 357 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 RWDD2BP57060 319 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 AGBL4Q5VU57 503 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 LAIR1Q6GTX8 287 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 LAYNQ6UX15 382 aa8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms