RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530309.1

CASP4-208, Transcript of caspase 4, human

TSL 2

Gene CASP4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CASP4-208	ENST00000530309	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
CASP4-208	ENST00000530309	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
CASP4-208	ENST00000530309	VEPH1	Q14D04	833 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CASP4-208	ENST00000530309	CCDC142	Q17RM4	750 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CASP4-208	ENST00000530309	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
CASP4-208	ENST00000530309	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CASP4-208	ENST00000530309	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CASP4-208	ENST00000530309	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CASP4-208	ENST00000530309	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
CASP4-208	ENST00000530309	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CASP4-208	ENST00000530309	MMP21	Q8N119	569 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CASP4-208	ENST00000530309	CNTROB	Q8N137	903 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CASP4-208	ENST00000530309	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CASP4-208	ENST00000530309	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CASP4-208	ENST00000530309	CEP76	Q8TAP6	659 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CASP4-208	ENST00000530309	RNF183	Q96D59	192 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CASP4-208	ENST00000530309	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
CASP4-208	ENST00000530309	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CASP4-208	ENST00000530309	BRF2	Q9HAW0	419 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CASP4-208	ENST00000530309	SEC14L2	O76054	403 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	EPN2	O95208	641 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	RABEP1	Q15276	862 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	TXNDC8	Q6A555	127 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	BICD2	Q8TD16	824 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	PIP5K1A	Q99755	562 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	LHPP	Q9H008	270 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	KLHL31	Q9H511	634 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	TTC36	A6NLP5	189 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	CLDN7	O95471	211 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	SPARC	P09486	303 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	IRF1	P10914	325 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	PCNA	P12004	261 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	EDN2	P20800	178 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	ICAM3	P32942	547 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	AVPR1A	P37288	418 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	CLDN2	P57739	230 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	RUNX2	Q13950	521 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	ERV3-1	Q14264	604 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	GSTA3	Q16772	222 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309		Q5PR19	223 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	CDC73	Q6P1J9	531 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	YME1L1	Q96TA2	773 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	CDT1	Q9H211	546 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	KRT84	Q9NSB2	600 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	TAF4	O00268	1085 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	CCNDBP1	O95273	360 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	CHRNB2	P17787	502 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	BSG	P35613	385 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	GABRB2	P47870	512 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	RASSF2	P50749	326 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	CDH12	P55289	794 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	ETFDH	Q16134	617 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	WDR78	Q5VTH9	848 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	PARM1	Q6UWI2	310 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	RBFA	Q8N0V3	343 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	NGEF	Q8N5V2	710 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	INPP5D	Q92835	1189 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	NUF2	Q9BZD4	464 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CASP4-208	ENST00000530309	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		6.25	□□□□□ -1.41

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