RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519057.5

COPS5-208, Transcript of COP9 signalosome subunit 5, human

TSL 4

Gene COPS5, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS5-208	ENST00000519057	FMO4	P31512	558 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	TTK	P33981	857 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	CENPA	P49450	140 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	CYP4A11	Q02928	519 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	ST3GAL1	Q11201	340 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	SNTA1	Q13424	505 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	LPIN1	Q14693	890 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	PGBD5	Q8N414	524 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	RNFT2	Q96EX2	444 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	DONSON	Q9NYP3	566 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057		A0A0B4J293	547 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	PRSS47	A8MTI9	375 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	BMPR1B	O00238	502 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	CH25H	O95992	272 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	SERPINC1	P01008	464 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	IL1A	P01583	271 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	DLG1	Q12959	904 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	CAPS	Q13938	189 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	XKR9	Q5GH70	373 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	MON1A	Q86VX9	555 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	SPATA20	Q8TB22	786 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	SCMH1	Q96GD3	660 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	TULP2	O00295	520 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	VNN2	O95498	520 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	IGLV2-11	P01706	119 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	TK1	P04183	234 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	MYF6	P23409	242 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	ADD2	P35612	726 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	HNF1B	P35680	557 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	ARSF	P54793	590 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	UBE4A	Q14139	1066 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	TRIM14	Q14142	442 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	TRIB2	Q92519	343 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	BICD1	Q96G01	975 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	IL17F	Q96PD4	163 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	NODAL	Q96S42	347 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	YME1L1	Q96TA2	773 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	SPRY4	Q9C004	299 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	CHODL	Q9H9P2	273 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COPS5-208	ENST00000519057	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COPS5-208	ENST00000519057	STX16	O14662	325 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COPS5-208	ENST00000519057	SLC25A17	O43808	307 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COPS5-208	ENST00000519057	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
COPS5-208	ENST00000519057	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
COPS5-208	ENST00000519057	SSTR2	P30874	369 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COPS5-208	ENST00000519057	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
COPS5-208	ENST00000519057	CXCR3	P49682	368 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COPS5-208	ENST00000519057	DDR1	Q08345	913 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COPS5-208	ENST00000519057	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
COPS5-208	ENST00000519057	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
COPS5-208	ENST00000519057	DCAF6	Q58WW2	860 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COPS5-208	ENST00000519057	CCDC174	Q6PII3	467 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COPS5-208	ENST00000519057	SMIM29	Q86T20	159 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COPS5-208	ENST00000519057	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COPS5-208	ENST00000519057	RNF183	Q96D59	192 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COPS5-208	ENST00000519057	HES6	Q96HZ4	224 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COPS5-208	ENST00000519057	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COPS5-208	ENST00000519057	MALT1	Q9UDY8	824 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COPS5-208	ENST00000519057	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
COPS5-208	ENST00000519057	NFS1	Q9Y697	457 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COPS5-208	ENST00000519057	DOCK7	Q96N67	2140 aa		4.51	□□□□□ -1.69
COPS5-208	ENST00000519057	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		4.51	□□□□□ -1.69
COPS5-208	ENST00000519057	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
COPS5-208	ENST00000519057	CPED1	A4D0V7	1026 aa		4.51	□□□□□ -1.69
COPS5-208	ENST00000519057	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		4.51	□□□□□ -1.69
COPS5-208	ENST00000519057	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		4.51	□□□□□ -1.69
COPS5-208	ENST00000519057	PRAC2	D3DTV9	90 aa		4.51	□□□□□ -1.69
COPS5-208	ENST00000519057	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		4.51	□□□□□ -1.69
COPS5-208	ENST00000519057	TNNT1	P13805	278 aa		4.51	□□□□□ -1.69
COPS5-208	ENST00000519057	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
COPS5-208	ENST00000519057	POSTN	Q15063	836 aa		4.51	□□□□□ -1.69
COPS5-208	ENST00000519057	SLC18A3	Q16572	532 aa		4.51	□□□□□ -1.69
COPS5-208	ENST00000519057	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		4.51	□□□□□ -1.69

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