RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515965.1

RNU6-377P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 377, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-377P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-377P-201ENST00000515965 PPP3CCP48454 512 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 PLCD1P51178 756 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 CDH12P55289 794 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZP1P60852 638 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 ADORA2A-AS1P86434 159 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 LPIN1Q14693 890 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 ODF3L2Q3SX64 289 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 DCAF12L2Q5VW00 463 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 TXNDC8Q6A555 127 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 COLCA1Q6ZS62 124 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 RRM2BQ7LG56 351 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC35F5Q8WV83 523 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 LPAR1Q92633 364 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMEM18Q96B42 140 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 RNF183Q96D59 192 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 NLRP4Q96MN2 994 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 YME1L1Q96TA2 773 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 MPHOSPH8Q99549 860 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 MSTO1Q9BUK6 570 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 CDT1Q9H211 546 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 VEZTQ9HBM0 779 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 SNTG1Q9NSN8 517 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 C20orf141Q9NUB4 165 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 ANKRD10Q9NXR5 420 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 SARDHQ9UL12 918 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 A0A087X0M5 115 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 A0A1B0GX30 115 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 A0A1W2PPH5 198 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 KLRF2D3W0D1 207 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 TGFB1I1O43294 461 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC25A17O43808 307 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 SOX30O94993 753 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 TOMM40O96008 361 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 LCATP04180 440 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC2A4P14672 509 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 SRD5A1P18405 259 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 CPOXP36551 454 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 GABRB2P47870 512 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 EFNA5P52803 228 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 P2RX3P56373 397 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 CLDN2P57739 230 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM27E3Q08E93 113 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRAF1Q13077 416 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 TAF11Q15544 211 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRTGQ2VWP7 1150 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRILQ7L0X0 811 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF367Q7RTV3 350 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 TBC1D26Q86UD7 250 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 DENND6AQ8IWF6 608 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMEM199Q8N511 208 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 C7orf57Q8NEG2 295 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 SCARB1Q8WTV0 552 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 SKA1Q96BD8 255 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 KLHL15Q96M94 604 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 FCRL4Q96PJ5 515 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 HEMGNQ9BXL5 484 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 PLAC1Q9HBJ0 212 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 IRAK4Q9NWZ3 460 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 TAS2R10Q9NYW0 307 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 RNF7Q9UBF6 113 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 NDRG3Q9UGV2 375 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 A4GNTQ9UNA3 340 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 ITIH6Q6UXX5 1313 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 A0A0U1RQF3 1178 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 BECN2A8MW95 431 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 CHL1O00533 1208 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 LDLRAD4O15165 306 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPRY3O43610 288 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 LDB2O43679 373 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 KLK8O60259 260 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 SYF2O95926 243 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 TBX18O95935 607 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 ITGAXP20702 1163 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 RFX2P48378 723 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 CCR9P51686 369 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMPRSS3P57727 454 aa2.81□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms