RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512677.1

PIK3R4-208, Transcript of phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 4, human

TSL 3

Gene PIK3R4, Length 744 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PIK3R4-208	ENST00000512677	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	TRNP1	Q6NT89	227 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	ERAP2	Q6P179	960 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	IQCH	Q86VS3	1027 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	STK40	Q8N2I9	435 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	PAF1	Q8N7H5	531 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	RLN3	Q8WXF3	142 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	HSPH1	Q92598	858 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	FATE1	Q969F0	183 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	MYO19	Q96H55	970 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	FEM1C	Q96JP0	617 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	GPR174	Q9BXC1	333 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	SEPT3	Q9UH03	358 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	HCN2	Q9UL51	889 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677		A0A1W2PP55	124 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677		A0A1W2PPC4	97 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	CFAP69	A5D8W1	941 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	NEMP1	O14524	444 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	SLC30A4	O14863	429 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	DCLK1	O15075	740 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	MID1	O15344	667 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	MTSS1	O43312	755 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	PSTPIP1	O43586	416 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	SPOP	O43791	374 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	BNIP3L	O60238	219 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	OPHN1	O60890	802 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	ZMPSTE24	O75844	475 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	NDUFA10	O95299	355 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	CFI	P05156	583 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	ZNF883	P0CG24	379 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	RARA	P10276	462 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	CDK4	P11802	303 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	ITGB7	P26010	798 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	AKT2	P31751	481 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	PSMD8	P48556	350 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	NR2C2	P49116	596 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	AP1S1	P61966	158 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	OGDH	Q02218	1023 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	BCL2L1	Q07817	233 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	KIF5A	Q12840	1032 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	SGCG	Q13326	291 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	ZNF235	Q14590	738 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	MESD	Q14696	234 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	LPAL2	Q16609	132 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	DBN1	Q16643	649 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	MYLK3	Q32MK0	819 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	MARC1	Q5VT66	337 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	TRIM69	Q86WT6	500 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PIK3R4-208	ENST00000512677	TC2N	Q8N9U0	490 aa		6.04	□□□□□ -1.44

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