RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512069.6

PDE4D-220, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4D, Length 536 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-220ENST00000512069 TMCC1O94876 653 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-220ENST00000512069 METTL18O95568 372 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-220ENST00000512069 DDAH2O95865 285 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-220ENST00000512069 CSF1P09603 554 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-220ENST00000512069 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-220ENST00000512069 KCNJ4P48050 445 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-220ENST00000512069 DUSP6Q16828 381 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-220ENST00000512069 CBWD5Q5RIA9 395 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-220ENST00000512069 ANO1Q5XXA6 986 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-220ENST00000512069 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa4.91□□□□□ -1.62
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PDE4D-220ENST00000512069 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
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PDE4D-220ENST00000512069 HIF1ANQ9NWT6 349 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-220ENST00000512069 PLK2Q9NYY3 685 aa4.91□□□□□ -1.62
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PDE4D-220ENST00000512069 ABCC5O15440 1437 aa4.9□□□□□ -1.62
PDE4D-220ENST00000512069 ATP10DQ9P241 1426 aa4.9□□□□□ -1.62
PDE4D-220ENST00000512069 WDR90Q96KV7 1748 aa4.9□□□□□ -1.62
PDE4D-220ENST00000512069 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-220ENST00000512069 STMND1H3BQB6 276 aa4.9□□□□□ -1.63
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PDE4D-220ENST00000512069 HTR6P50406 440 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-220ENST00000512069 SELENOVP59797 346 aa4.9□□□□□ -1.63
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PDE4D-220ENST00000512069 ARHGAP8P85298 464 aa4.9□□□□□ -1.63
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PDE4D-220ENST00000512069 EFR3AQ14156 821 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-220ENST00000512069 ADCK5Q3MIX3 580 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-220ENST00000512069 RUNDC3AQ59EK9 446 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-220ENST00000512069 DCAF12L2Q5VW00 463 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-220ENST00000512069 PDXDC1Q6P996 788 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-220ENST00000512069 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-220ENST00000512069 HERC6Q8IVU3 1022 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-220ENST00000512069 TMEM57Q8N5G2 664 aa4.9□□□□□ -1.63
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PDE4D-220ENST00000512069 CD207Q9UJ71 328 aa4.9□□□□□ -1.63
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PDE4D-220ENST00000512069 BECN2A8MW95 431 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-220ENST00000512069 HSPB6O14558 160 aa4.89□□□□□ -1.63
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PDE4D-220ENST00000512069 UPB1Q9UBR1 384 aa4.89□□□□□ -1.63
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PDE4D-220ENST00000512069 SPRY3O43610 288 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-220ENST00000512069 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
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PDE4D-220ENST00000512069 LCATP04180 440 aa4.88□□□□□ -1.63
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PDE4D-220ENST00000512069 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
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PDE4D-220ENST00000512069 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-220ENST00000512069 CCKBRP32239 447 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-220ENST00000512069 AVPR1AP37288 418 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-220ENST00000512069 CLCNKBP51801 687 aa4.88□□□□□ -1.63
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