RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 H2AFVQ71UI9 128 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 NAXDQ8IW45 347 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 PLPP6Q8IY26 295 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 SP110Q9HB58 689 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 TM7SF3Q9NS93 570 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 UVRAGQ9P2Y5 699 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 BTBD3Q9Y2F9 522 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 FADS3Q9Y5Q0 445 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 FRYQ5TBA9 3013 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 C16orf96A6NNT2 1141 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC31A1O15431 190 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 MFSD11O43934 449 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 PCDH8O95206 1070 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 ITIH2P19823 946 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 IL4RP24394 825 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 ARL4AP40617 200 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF75DP51815 510 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 C21orf59P57076 290 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 KRT81Q14533 505 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 BOLA3Q53S33 107 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF805Q5CZA5 627 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 HORMAD1Q86X24 394 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM145Q8NBT3 493 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC42Q96M95 316 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 NSMCE3Q96MG7 304 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 NCAPGQ9BPX3 1015 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 TFR2Q9UP52 801 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 AKAP13Q12802 2813 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 UPK3BL1B0FP48 263 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 UPK3BL2E5RIL1 263 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 POP4O95707 220 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 CEACAM1P13688 526 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 DPYSL3Q14195 570 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 SHBQ15464 509 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF423Q2M1K9 1284 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 FBXL19Q6PCT2 694 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 IL27RAQ6UWB1 636 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 TMCO3Q6UWJ1 677 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 ZSWIM9Q86XI8 627 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM71BQ8TC56 605 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 RAD51BO15315 384 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 MAP3K6O95382 1288 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 PEX11BO96011 259 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF883P0CG24 379 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 PMLP29590 882 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 CCT8P50990 548 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 CLDN2P57739 230 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 NXPH1P58417 271 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 MESDQ14696 234 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 GDPD4Q6W3E5 623 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 GCNT7Q6ZNI0 430 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC35G2Q8TBE7 412 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 LRIG1Q96JA1 1093 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 DMTF1Q9Y222 760 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 CBFA2T3O75081 653 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 PALMO75781 387 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 PRKCGP05129 697 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 MAN1A1P33908 653 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 IL10RBQ08334 325 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC10A7Q0GE19 358 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC14A1Q13336 389 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 GATAD2AQ86YP4 633 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 LRRN4Q8WUT4 740 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 RFFLQ8WZ73 363 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 CALN1Q9BXU9 219 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 DONSONQ9NYP3 566 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 HYOU1Q9Y4L1 999 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 CHD8Q9HCK8 2581 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1B0GTQ1 180 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 TLR4O00206 839 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 AREL1O15033 823 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 AP1G1O43747 822 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 SEMG2Q02383 582 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 FOXC1Q12948 553 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 HADHQ16836 314 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP2-218ENST00000511185 NEK5Q6P3R8 708 aa18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms