RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509870.1

HOXC-AS3-201, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 544 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SKILP12757 684 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GKP32189 559 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HCAR3P49019 387 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SUOXP51687 545 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UBASH3AP57075 661 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ILKQ13418 452 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GRM3Q14832 879 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HS1BP3Q53T59 392 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GCNT7Q6ZNI0 430 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 Q6ZSR6 202 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LUZP1Q86V48 1076 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 VPS36Q86VN1 386 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMPRSS12Q86WS5 348 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR13H1Q8NG92 308 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HCAR2Q8TDS4 363 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TSC1Q92574 1164 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF653Q96CK0 615 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KLHL32Q96NJ5 620 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CALN1Q9BXU9 219 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KLC2Q9H0B6 622 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LRRC19Q9H756 370 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FZD3Q9NPG1 666 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PCSK1NQ9UHG2 260 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AKAP13Q12802 2813 aa15.34■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IGLON5A6NGN9 336 aa15.34■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ARHGAP42A6NI28 874 aa15.34■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FPGTO14772 594 aa15.34■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AREL1O15033 823 aa15.34■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRAMEF11O60813 436 aa15.34■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CAPNS1P04632 268 aa15.34■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CKMT2P17540 419 aa15.34■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DGKAP23743 735 aa15.34■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MIPP30301 263 aa15.34■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PCK1P35558 622 aa15.34■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RABIFP47224 123 aa15.34■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CLDN2P57739 230 aa15.34■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FGL2Q14314 439 aa15.34■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CCDC157Q569K6 752 aa15.34■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DHRS13Q6UX07 377 aa15.34■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RFX8Q6ZV50 586 aa15.34■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DENND6BQ8NEG7 585 aa15.34■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 VOPP1Q96AW1 172 aa15.34■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BMFQ96LC9 184 aa15.34■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa15.34■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CHD5Q8TDI0 1954 aa15.34■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NEMP2A6NFY4 417 aa15.33■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RFPL3O75679 317 aa15.33■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SERPING1P05155 500 aa15.33■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PBX1P40424 430 aa15.33■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ABL2P42684 1182 aa15.33■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZBED6P86452 979 aa15.33■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CYTH1Q15438 398 aa15.33■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CA9Q16790 459 aa15.33■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BOLA3Q53S33 107 aa15.33■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DNAAF5Q86Y56 855 aa15.33■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC25A45Q8N413 288 aa15.33■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LZTR1Q8N653 840 aa15.33■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP15.33■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa15.33■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRIM7Q9C029 511 aa15.33■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC39A8Q9C0K1 460 aa15.33■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PDFQ9HBH1 243 aa15.33■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GPR27Q9NS67 375 aa15.33■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MYO1AQ9UBC5 1043 aa15.33■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LHX3Q9UBR4 397 aa15.33■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CAPN11Q9UMQ6 739 aa15.33■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 POM121BA6NF01 834 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TOR1BO14657 336 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RAD51BO15315 384 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SDC3O75056 442 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LRCH4O75427 683 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PIAS2O75928 621 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TIMP2P16035 220 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ERCC2P18074 760 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 XPAP23025 273 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HNF1BP35680 557 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CSNK1DP48730 415 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ACADVLP49748 655 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP15.32■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ELP6Q0PNE2 266 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DNAJC3Q13217 504 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AFMIDQ63HM1 303 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HGSNATQ68CP4 663 aa15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms