RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497842.6

TTC19-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 19, human

TSL 5

Gene TTC19, Length 1,360 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC19-208	ENST00000497842	FRS2	Q8WU20	508 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	NOD2	Q9HC29	1040 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	CA14	Q9ULX7	337 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	EGF	P01133	1207 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	TPSB2	P20231	275 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	28.88	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	TPSAB1	Q15661	275 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	ELF2	Q15723	593 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	CARD16	Q5EG05	197 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	SHD	Q96IW2	340 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	UBP1	Q9NZI7	540 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	F5	P12259	2224 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	AP2A1	O95782	977 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	MMP2	P08253	660 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	PLTP	P55058	493 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	SKOR1	P84550	965 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	RAD51	Q06609	339 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	FBXO43	Q4G163	708 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842		Q6ZVU0	165 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	ART4	Q93070	314 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	TMEM245	Q9H330	911 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	BNIP3L	O60238	219 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	PMPCB	O75439	489 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	TNFRSF8	P28908	595 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	SEC13	P55735	322 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	MYLK3	Q32MK0	819 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	EMC10	Q5UCC4	262 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	WDR93	Q6P2C0	686 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	TADA1	Q96BN2	335 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	SUN2	Q9UH99	717 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	GJB3	O75712	270 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	CA4	P22748	312 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	GRM3	Q14832	879 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	KCTD11	Q693B1	232 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	CHPF	Q8IZ52	775 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	HCN2	Q9UL51	889 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	SHISA7	A6NL88	538 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	TIE1	P35590	1138 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	IL12RB1	P42701	662 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	WNT3A	P56704	352 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	SDE2	Q6IQ49	451 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	KDELC1	Q6UW63	502 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	LINC00523	Q86TU6	105 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	IPMK	Q8NFU5	416 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	SUN1	O94901	812 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	PRKCH	P24723	683 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	ENPP2	Q13822	863 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	PCSK7	Q16549	785 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		28.83	■■■□□ 2.21

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