RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 EDEM3Q9BZQ6 932 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 CLPBQ9H078 707 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 ZMYND15Q9H091 742 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 CDH19Q9H159 772 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 DDIT4Q9NX09 232 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 VPS51Q9UID3 782 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 VANGL2Q9ULK5 521 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 BSNQ9UPA5 3926 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 A1L4Q6 167 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 PRR19A6NJB7 356 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 MKRN2OSH3BPM6 223 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 HGSO14964 777 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 KLRC4O43908 158 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 TM7SF2O76062 418 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 FYNP06241 537 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 PNLIPP16233 465 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 BRD2P25440 801 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 UGT1A3P35503 534 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 IGFALSP35858 605 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 ME1P48163 572 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 MLLT10P55197 1068 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 CDC20Q12834 499 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 LRMPQ12912 555 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 AUHQ13825 339 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 CNGA2Q16280 664 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 AMZ1Q400G9 498 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 CERCAMQ5T4B2 595 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 SYPL2Q5VXT5 272 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 RETSATQ6NUM9 610 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 ENPP7Q6UWV6 458 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 LINGO4Q6UY18 593 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 SPRED1Q7Z699 444 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 OR52K2Q8NGK3 314 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 TFAP2BQ92481 460 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 NKD1Q969G9 470 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 ABHD17AQ96GS6 310 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 CEP44Q9C0F1 390 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 SIK2Q9H0K1 926 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 PRDM8Q9NQV8 689 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 KLQ9UEF7 1012 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 APPL1Q9UKG1 709 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 OR51B4Q9Y5P0 310 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 WASF2Q9Y6W5 498 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 SCN8AQ9UQD0 1980 aa6.24□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 TTLL8A6PVC2 850 aa6.24□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 B4DGG1 531 aa6.24□□□□□ -1.41
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CBX1-205ENST00000495350 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 RAD1O60671 282 aa6.24□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 GABBR2O75899 941 aa6.24□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 KRT38O76015 456 aa6.24□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 RHOBTB3O94955 611 aa6.24□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 CPNE6O95741 557 aa6.24□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 DDAH2O95865 285 aa6.24□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 TNFP01375 233 aa6.24□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 MYL1P05976 194 aa6.24□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 GNLYP22749 145 aa6.24□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 XPAP23025 273 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 TNFRSF8P28908 595 aa6.24□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 OR1E1P30953 314 aa6.24□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP6.24□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 MAN1A1P33908 653 aa6.24□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 GGCXP38435 758 aa6.24□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 UQCRFS1P47985 274 aa6.24□□□□□ -1.41
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CBX1-205ENST00000495350 NME3Q13232 169 aa6.24□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 ESPL1Q14674 2120 aa6.24□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 C16orf72Q14CZ0 275 aa6.24□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 ALG11Q2TAA5 492 aa6.24□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 DEFB109BQ30KR1 87 aa6.24□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 CBWD6Q4V339 395 aa6.24□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 C14orf28Q4W4Y0 310 aa6.24□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 ZNF805Q5CZA5 627 aa6.24□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 CARD16Q5EG05 197 aa6.24□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 EFHC2Q5JST6 749 aa6.24□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 CBWD3Q5JTY5 395 aa6.24□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 CBWD5Q5RIA9 395 aa6.24□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 LRRC31Q6UY01 552 aa6.24□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 KDELC2Q7Z4H8 507 aa6.24□□□□□ -1.41
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