RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489603.5

LRRFIP1-214, Transcript of LRR binding FLII interacting protein 1, human

TSL 3

Gene LRRFIP1, Length 531 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRRFIP1-214	ENST00000489603	MGAT2	Q10469	447 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	TRPC3	Q13507	836 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	BEND5	Q7L4P6	421 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	XYLT1	Q86Y38	959 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	SYT12	Q8IV01	421 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	VRK3	Q8IV63	474 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	TTC39C	Q8N584	583 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	RFFL	Q8WZ73	363 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	APBB2	Q92870	758 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	FNBP1	Q96RU3	617 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	PLIN2	Q99541	437 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	ADI1	Q9BV57	179 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	NUP58	Q9BVL2	599 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	BCO1	Q9HAY6	547 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	RGL1	Q9NZL6	768 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	SYCE3	A1L190	88 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	ZNF233	A6NK53	670 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603		E9PMD0	336 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	EXOC3	O60645	756 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	MED24	O75448	989 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	FAM155B	O75949	473 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	DNTT	P04053	509 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	ASGR1	P07306	291 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	ITGA5	P08648	1049 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	STAG3L1	P0CL83	205 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	CCL5	P13501	91 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	DES	P17661	470 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	CCNE1	P24864	410 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	MARK3	P27448	753 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	CDC25A	P30304	524 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	STAT1	P42224	750 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	NPTX2	P47972	431 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	LBX1	P52954	281 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	ACLY	P53396	1101 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	PTTG1IP	P53801	180 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	PEX3	P56589	373 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	FAM189B	P81408	668 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	MAPK7	Q13164	816 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	ITGA7	Q13683	1181 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	EMC2	Q15006	297 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	PLCB4	Q15147	1175 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	RAB30	Q15771	203 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	PTGIS	Q16647	500 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	METRNL	Q641Q3	311 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	ANKS6	Q68DC2	871 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	NOTUM	Q6P988	496 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603		Q6YL49	198 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRFIP1-214	ENST00000489603	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63

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