RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 GRAPQ13588 217 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 COL28A1Q2UY09 1125 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 TBC1D25Q3MII6 688 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 COLEC12Q5KU26 742 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 CST9LP1Q5W188 147 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 IYDQ6PHW0 289 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 SUSD1Q6UWL2 747 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 CFAP77Q6ZQR2 320 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
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RABGGTB-209ENST00000473406 LNX2Q8N448 690 aa6.27□□□□□ -1.41
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RABGGTB-209ENST00000473406 GRK7Q8WTQ7 553 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 RFKQ969G6 155 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM89AQ96GI7 184 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 KAZALD1Q96I82 304 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 OR2A14Q96R47 310 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa6.27□□□□□ -1.41
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RABGGTB-209ENST00000473406 CD320Q9NPF0 282 aa6.27□□□□□ -1.41
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RABGGTB-209ENST00000473406 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 DNAJB9Q9UBS3 223 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 AMACRQ9UHK6 382 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 ICKQ9UPZ9 632 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 TRAV34A0A0B4J273 112 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
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RABGGTB-209ENST00000473406 WDR27A2RRH5 827 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM247A6NEH6 219 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 NKX2-2O95096 273 aa6.26□□□□□ -1.41
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RABGGTB-209ENST00000473406 IL1AP01583 271 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 TFP02787 698 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 FYNP06241 537 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 RFPL3SP0C7P2 107 aa6.26□□□□□ -1.41
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RABGGTB-209ENST00000473406 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
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RABGGTB-209ENST00000473406 RABL3Q5HYI8 236 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF804AQ7Z570 1209 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
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RABGGTB-209ENST00000473406 MCUQ8NE86 351 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 NSMCE1Q8WV22 266 aa6.26□□□□□ -1.41
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RABGGTB-209ENST00000473406 DUSP22Q9NRW4 184 aa6.26□□□□□ -1.41
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RABGGTB-209ENST00000473406 PSD3Q9NYI0 1048 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 SEMA5BQ9P283 1151 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 LRIT1Q9P2V4 623 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 FBXO40Q9UH90 709 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 OSGIN1Q9UJX0 560 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF536O15090 1300 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 LRRC72A6NJI9 287 aa6.25□□□□□ -1.41
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RABGGTB-209ENST00000473406 APEHP13798 732 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 IL7RP16871 459 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 ACO1P21399 889 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
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RABGGTB-209ENST00000473406 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 RHAGQ02094 409 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 ACSM2AQ08AH3 577 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 NFE2L1Q14494 772 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 MFSD13AQ14CX5 517 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 PTPRRQ15256 657 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 ME3Q16798 604 aa6.25□□□□□ -1.41
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