RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465122.5

PDCD6IP-208, Transcript of programmed cell death 6 interacting protein, human

TSL 3

Gene PDCD6IP, Length 894 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	NAGS	Q8N159	534 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SPATA20	Q8TB22	786 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	EID2B	Q96D98	161 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	UHRF2	Q96PU4	802 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	PKP4	Q99569	1192 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	RTKN	Q9BST9	563 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	ACAD9	Q9H845	621 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	LZTS1	Q9Y250	596 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122		A0A0U1RQJ8	604 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	MAPK9	P45984	424 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	CDK7	P50613	346 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	ARL4C	P56559	192 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	KRTAP10-5	P60370	271 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	PKP1	Q13835	747 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TAF5	Q15542	800 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TIGD6	Q17RP2	521 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	GALNT7	Q86SF2	657 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	RBFA	Q8N0V3	343 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	PAF1	Q8N7H5	531 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	C3orf49	Q96BT1	292 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	FEM1C	Q96JP0	617 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	CLPB	Q9H078	707 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	RRN3	Q9NYV6	651 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	KL	Q9UEF7	1012 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SCN5A	Q14524	2016 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122		A0A0A0MQY5	61 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	DYTN	A2CJ06	578 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	CHL1	O00533	1208 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	CH25H	O95992	272 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	IL1A	P01583	271 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SERPINA4	P29622	427 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	CYP4A11	Q02928	519 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	ST3GAL1	Q11201	340 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	DLG1	Q12959	904 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	CALCRL	Q16602	461 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SCAI	Q8N9R8	606 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	MAF1	Q9H063	256 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TMEM51	Q9NW97	253 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PDCD6IP-208	ENST00000465122	PRAC2	D3DTV9	90 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PDCD6IP-208	ENST00000465122	NCAM2	O15394	837 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PDCD6IP-208	ENST00000465122	ACTL6B	O94805	426 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PDCD6IP-208	ENST00000465122	GYS1	P13807	737 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PDCD6IP-208	ENST00000465122	GM2A	P17900	193 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PDCD6IP-208	ENST00000465122	CD53	P19397	219 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PDCD6IP-208	ENST00000465122	DGKA	P23743	735 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PDCD6IP-208	ENST00000465122	PNLIPRP1	P54315	467 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PDCD6IP-208	ENST00000465122	PHEX	P78562	749 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PDCD6IP-208	ENST00000465122	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PDCD6IP-208	ENST00000465122	RALBP1	Q15311	655 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PDCD6IP-208	ENST00000465122	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PDCD6IP-208	ENST00000465122	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PDCD6IP-208	ENST00000465122	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PDCD6IP-208	ENST00000465122	FSIP1	Q8NA03	581 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PDCD6IP-208	ENST00000465122	FBXO17	Q96EF6	278 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PDCD6IP-208	ENST00000465122	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PDCD6IP-208	ENST00000465122	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76

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