RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460170.2

PTPRU-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,337 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-205ENST00000460170 SELENONQ9NZV5 590 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 SH3BP4Q9P0V3 963 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 S100A3P33764 101 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 STARD3Q14849 445 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 DDR2Q16832 855 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 FAM110CQ1W6H9 321 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 CCDC185Q8N715 623 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 EPS8L2Q9H6S3 715 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 FETUBQ9UGM5 382 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 ATP6AP2O75787 350 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 AP2A1O95782 977 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 FGFR3P22607 806 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 SERPINA4P29622 427 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 NAA20P61599 178 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 VSTM1Q6UX27 236 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 MCRS1Q96EZ8 462 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 VPS45Q9NRW7 570 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 ARL15Q9NXU5 204 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 CKBP12277 381 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 CRY1Q16526 586 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 TJAP1Q5JTD0 557 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 TMEM26Q6ZUK4 368 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.031e-6■■■■■ 27.9
PTPRU-205ENST00000460170 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 FANCGO15287 622 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 FGF1P05230 155 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 HGFP14210 728 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 GPD2P43304 727 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 PDK3Q15120 406 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 CHRAC1Q9NRG0 131 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 KRT8P05787 483 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 COL6A2P12110 1019 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 KLF10Q13118 480 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 SDE2Q6IQ49 451 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 ISLR2Q6UXK2 745 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 SYTL1Q8IYJ3 562 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 CLYBLQ8N0X4 340 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 BANPQ8N9N5 519 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 ACTRT2Q8TDY3 377 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 MED8Q96G25 268 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 SLC4A5Q9BY07 1137 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 DPEP3Q9H4B8 488 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 RHBDL2Q9NX52 303 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 KLQ9UEF7 1012 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 ZNF536O15090 1300 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 TREHO43280 583 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 POU1F1P28069 291 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 ABL2P42684 1182 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 PYROXD2Q8N2H3 581 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 PLEKHO2Q8TD55 490 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 SNX27Q96L92 541 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 KLHL5Q96PQ7 755 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 RTKNQ9BST9 563 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 TRMOQ9BU70 441 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 ASB8Q9H765 288 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 TMEM63AO94886 807 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 C22orf31O95567 290 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 PPM1JQ5JR12 505 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 OTOP3Q7RTS5 596 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 TMCO1Q9UM00 188 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 TM7SF2O76062 418 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 CYP3A5P20815 502 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 ATP6V0D1P61421 351 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 KIAA2013Q8IYS2 634 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 ZNF567Q8N184 647 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 GRIP2Q9C0E4 1043 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 MIEF1Q9NQG6 463 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 FAM53CQ9NYF3 392 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 AP3M1Q9Y2T2 418 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 A8MX80 341 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 AZIN1O14977 448 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 ZBTB14O43829 449 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 MPSTP25325 297 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 LILRA4P59901 499 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 FKBP1BP68106 108 aa14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms