RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 CSPG4P5Q96PW8 444 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 NCAPGQ9BPX3 1015 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 RBSNQ9H1K0 784 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 TLR4O00206 839 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 SPINT1O43278 529 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 ARL4AP40617 200 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 HCAR3P49019 387 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 NXPH1P58417 271 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 TAS2R40P59535 323 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 FGL2Q14314 439 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 SHBQ15464 509 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 KDM7AQ6ZMT4 941 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 SP110Q9HB58 689 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 H2AFZP0C0S5 128 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 CCT8P50990 548 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 CDH6P55285 790 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 CCDC15Q0P6D6 951 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 KRT81Q14533 505 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 STAT4Q14765 748 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM259Q4ZIN3 620 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 H2AFVQ71UI9 128 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 RHBDD1Q8TEB9 315 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 DMTF1Q9Y222 760 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 A0A1B0GTQ1 180 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 IGLON5A6NGN9 336 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 RAD51BO15315 384 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF883P0CG24 379 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 SEMG2Q02383 582 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC45A4Q5BKX6 768 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 NEK5Q6P3R8 708 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 SARM1Q6SZW1 724 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 PNPLA1Q8N8W4 532 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 MFSD2AQ8NA29 543 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 TEKT4Q8WW24 435 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 SKA1Q96BD8 255 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 GDF3Q9NR23 364 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 DONSONQ9NYP3 566 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 TRPM6Q9BX84 2022 aa24.2■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 GOLGA8CPA6NN73 597 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP5-208ENST00000459627 NEMP1O14524 444 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP5-208ENST00000459627 MUSKO15146 869 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP5-208ENST00000459627 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
SH3BP5-208ENST00000459627 CBFA2T3O75081 653 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP5-208ENST00000459627 PALMO75781 387 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP5-208ENST00000459627 PROSCO94903 275 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP5-208ENST00000459627 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
SH3BP5-208ENST00000459627 PRKCGP05129 697 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP5-208ENST00000459627 TIMP2P16035 220 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP5-208ENST00000459627 RAD51Q06609 339 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP5-208ENST00000459627 BNIP3Q12983 259 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP5-208ENST00000459627 GCNT7Q6ZNI0 430 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP5-208ENST00000459627 TTC7BQ86TV6 843 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP5-208ENST00000459627 GAS2L3Q86XJ1 694 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM145Q8NBT3 493 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP5-208ENST00000459627 TSC1Q92574 1164 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP5-208ENST00000459627 LRIG1Q96JA1 1093 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP5-208ENST00000459627 FEM1CQ96JP0 617 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP5-208ENST00000459627 CCDC42Q96M95 316 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP5-208ENST00000459627 NSMCE3Q96MG7 304 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP5-208ENST00000459627 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP5-208ENST00000459627 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM253P0C7T8 217 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP5-208ENST00000459627 IL4RP24394 825 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP5-208ENST00000459627 MESDQ14696 234 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP5-208ENST00000459627 TMCO3Q6UWJ1 677 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP5-208ENST00000459627 DBX2Q6ZNG2 339 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP5-208ENST00000459627 OR13H1Q8NG92 308 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC35G2Q8TBE7 412 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP5-208ENST00000459627 KLHDC7BQ96G42 594 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC17A9Q9BYT1 436 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP5-208ENST00000459627 UVRAGQ9P2Y5 699 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP5-208ENST00000459627 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP5-208ENST00000459627 AP1G1O43747 822 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP5-208ENST00000459627 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
SH3BP5-208ENST00000459627 MMP20O60882 483 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP5-208ENST00000459627 SDC3O75056 442 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP5-208ENST00000459627 MAP3K6O95382 1288 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP5-208ENST00000459627 THEGLP0DJG4 465 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP5-208ENST00000459627 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
SH3BP5-208ENST00000459627 AKT2P31751 481 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP5-208ENST00000459627 NUDT1P36639 197 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP5-208ENST00000459627 ARSEP51690 589 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms