RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445667.6

USE1-202, Transcript of unconventional SNARE in the ER 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene USE1, Length 795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USE1-202ENST00000445667 CCT8P50990 548 aa14.96□□□□□ -0.01
USE1-202ENST00000445667 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
USE1-202ENST00000445667 NXPH1P58417 271 aa14.96□□□□□ -0.01
USE1-202ENST00000445667 RAD51Q06609 339 aa14.96□□□□□ -0.01
USE1-202ENST00000445667 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
USE1-202ENST00000445667 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa14.96□□□□□ -0.01
USE1-202ENST00000445667 LRRC73Q5JTD7 316 aa14.96□□□□□ -0.01
USE1-202ENST00000445667 H2AFVQ71UI9 128 aa14.96□□□□□ -0.01
USE1-202ENST00000445667 TTC7BQ86TV6 843 aa14.96□□□□□ -0.01
USE1-202ENST00000445667 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
USE1-202ENST00000445667 MFSD2AQ8NA29 543 aa14.96□□□□□ -0.01
USE1-202ENST00000445667 TEKT4Q8WW24 435 aa14.96□□□□□ -0.01
USE1-202ENST00000445667 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
USE1-202ENST00000445667 TMEM131Q92545 1883 aa14.96□□□□□ -0.01
USE1-202ENST00000445667 CSPG4P5Q96PW8 444 aa14.96□□□□□ -0.01
USE1-202ENST00000445667 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
USE1-202ENST00000445667 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa14.96□□□□□ -0.01
USE1-202ENST00000445667 TRIM5Q9C035 493 aa14.96□□□□□ -0.01
USE1-202ENST00000445667 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
USE1-202ENST00000445667 PCDH18Q9HCL0 1135 aa14.96□□□□□ -0.01
USE1-202ENST00000445667 GDF3Q9NR23 364 aa14.96□□□□□ -0.01
USE1-202ENST00000445667 SPTLC3Q9NUV7 552 aa14.96□□□□□ -0.01
USE1-202ENST00000445667 GGT7Q9UJ14 662 aa14.96□□□□□ -0.01
USE1-202ENST00000445667 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa14.96□□□□□ -0.01
USE1-202ENST00000445667 ITM2BQ9Y287 266 aa14.96□□□□□ -0.01
USE1-202ENST00000445667 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa14.96□□□□□ -0.01
USE1-202ENST00000445667 DOCK9Q9BZ29 2069 aa14.96□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 A0A1B0GTQ1 180 aa14.95□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 AP1G1O43747 822 aa14.95□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 PALMO75781 387 aa14.95□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 PIGNO95427 931 aa14.95□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 SPINK2P20155 84 aa14.95□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 GJC1P36383 396 aa14.95□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 RGRP47804 291 aa14.95□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 CLDN2P57739 230 aa14.95□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 MMRN1Q13201 1228 aa14.95□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 FGL2Q14314 439 aa14.95□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 SHBQ15464 509 aa14.95□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 TMEM259Q4ZIN3 620 aa14.95□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 SARM1Q6SZW1 724 aa14.95□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 GATAD2AQ86YP4 633 aa14.95□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 LZTR1Q8N653 840 aa14.95□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 TMEM145Q8NBT3 493 aa14.95□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 CCDC42Q96M95 316 aa14.95□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa14.95□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 SLC17A9Q9BYT1 436 aa14.95□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa14.95□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 SP110Q9HB58 689 aa14.95□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 UVRAGQ9P2Y5 699 aa14.95□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa14.95□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 IGLON5A6NGN9 336 aa14.94□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 NEMP1O14524 444 aa14.94□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 FLRT2O43155 660 aa14.94□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 SPINT1O43278 529 aa14.94□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 PCDHGA12O60330 932 aa14.94□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 DFNA5O60443 496 aa14.94□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 PROSCO94903 275 aa14.94□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 CD48P09326 243 aa14.94□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 TMEM253P0C7T8 217 aa14.94□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 TIMP2P16035 220 aa14.94□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 IL4RP24394 825 aa14.94□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 AKT2P31751 481 aa14.94□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 CDH6P55285 790 aa14.94□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 TAS2R40P59535 323 aa14.94□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 RPS21P63220 83 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 IL10RBQ08334 325 aa14.94□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 BNIP3Q12983 259 aa14.94□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 KRT81Q14533 505 aa14.94□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 HADHQ16836 314 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa14.94□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 TMCO3Q6UWJ1 677 aa14.94□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 RAB7BQ96AH8 199 aa14.94□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 KLHDC7BQ96G42 594 aa14.94□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 WASF3Q9UPY6 502 aa14.94□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 PCNX2A6NKB5 2137 aa14.93□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa14.93□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 AREL1O15033 823 aa14.93□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 RAD51BO15315 384 aa14.93□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 TSPAN6O43657 245 aa14.93□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 MAGEC1O60732 1142 aa14.93□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 THEGLP0DJG4 465 aa14.93□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 SHC2P98077 582 aa14.93□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 OVGP1Q12889 678 aa14.93□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 SRLQ86TD4 932 aa14.93□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 SLCO6A1Q86UG4 719 aa14.93□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 IQCHQ86VS3 1027 aa14.93□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 CAMK1DQ8IU85 385 aa14.93□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 CNGA4Q8IV77 575 aa14.93□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 PNPLA1Q8N8W4 532 aa14.93□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 OR13H1Q8NG92 308 aa14.93□□□□□ -0.02
USE1-202ENST00000445667 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms