RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM110BQ8TC76 370 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 LPAR1Q92633 364 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 SLCO4A1Q96BD0 722 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 ZBED2Q9BTP6 218 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 ADI1Q9BV57 179 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 IMPG2Q9BZV3 1241 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
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RABGEF1-203ENST00000439720 ACSS2Q9NR19 701 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 HACD3Q9P035 362 aa8.5□□□□□ -1.05
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RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM191BP0C7N4 346 aa8.49□□□□□ -1.05
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RABGEF1-203ENST00000439720 NOMO3P69849 1222 aa8.49□□□□□ -1.05
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RABGEF1-203ENST00000439720 OGDHQ02218 1023 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 OCA2Q04671 838 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 VGLL4Q14135 290 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 GALNT13Q8IUC8 556 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 C12orf56Q8IXR9 622 aa8.49□□□□□ -1.05
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RABGEF1-203ENST00000439720 CBR4Q8N4T8 237 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
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RABGEF1-203ENST00000439720 GLT1D1Q96MS3 346 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 IL12RB2Q99665 862 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 HSD17B14Q9BPX1 270 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 AMNQ9BXJ7 453 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 POPDC2Q9HBU9 364 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 PNPLA8Q9NP80 782 aa8.49□□□□□ -1.05
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RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM9Q9P0T7 183 aa8.49□□□□□ -1.05
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RABGEF1-203ENST00000439720 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRC72A6NJI9 287 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 GOLGA8CPA6NN73 597 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 WDR64B1ANS9 1081 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 TAF4O00268 1085 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 NRP1O14786 923 aa8.49□□□□□ -1.05
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RABGEF1-203ENST00000439720 IST1P53990 364 aa8.49□□□□□ -1.05
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RABGEF1-203ENST00000439720 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM198Q66K66 360 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 DCUN1D2Q6PH85 259 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM160B2Q86V87 743 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC22A16Q86VW1 577 aa8.49□□□□□ -1.05
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RABGEF1-203ENST00000439720 HMG20AQ9NP66 347 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 HPS4Q9NQG7 708 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 RAB6BQ9NRW1 208 aa8.49□□□□□ -1.05
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RABGEF1-203ENST00000439720 PRKCHP24723 683 aa8.48□□□□□ -1.05
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RABGEF1-203ENST00000439720 RHDQ02161 417 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 TMTC4Q5T4D3 741 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 SLFN13Q68D06 897 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 IQSEC1Q6DN90 963 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 UNC5AQ6ZN44 842 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC81Q6ZN84 652 aa8.48□□□□□ -1.05
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