RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429504.6

CERS1-201, Transcript of ceramide synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CERS1, Length 2,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS1-201ENST00000429504 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 NEPROQ6NW34 567 aa27.93■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 KDELC2Q7Z4H8 507 aa27.93■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 TEX26Q8N6G2 289 aa27.93■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 POU5F2Q8N7G0 328 aa27.93■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 MAPK15Q8TD08 544 aa27.93■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 CALML6Q8TD86 181 aa27.93■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 CLPTM1LQ96KA5 538 aa27.93■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 PANX3Q96QZ0 392 aa27.93■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 SP110Q9HB58 689 aa27.93■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 A0A087X1B8 175 aa27.93■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 J3KR12 359 aa27.93■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 CNTN5O94779 1100 aa27.93■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 CHRNGP07510 517 aa27.93■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 RPL14P50914 215 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 SLC10A7Q0GE19 358 aa27.93■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa27.93■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 TCF7L2Q9NQB0 619 aa27.93■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 XPR1Q9UBH6 696 aa27.93■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 A0A088AWK7 358 aa27.92■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 HDAC3O15379 428 aa27.92■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 PGGT1BP53609 377 aa27.92■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 ASPHQ12797 758 aa27.92■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 PRKAA1Q13131 559 aa27.92■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 FAM171A1Q5VUB5 890 aa27.92■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 SLC43A3Q8NBI5 491 aa27.92■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 ELMO2Q96JJ3 720 aa27.92■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 ZNF212Q9UDV6 495 aa27.92■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 IGLV3-27P01718 113 aa27.91■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 ATP6V1C1P21283 382 aa27.91■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 MPSTP25325 297 aa27.91■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 CD86P42081 329 aa27.91■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 SESN3P58005 492 aa27.91■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 ZNF460Q14592 562 aa27.91■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 NAA25Q14CX7 972 aa27.91■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 SNX30Q5VWJ9 437 aa27.91■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 FBXL22Q6P050 247 aa27.91■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 MARCH2Q9P0N8 246 aa27.91■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 DCXO43602 365 aa27.91■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 MMP2P08253 660 aa27.91■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 GLDCP23378 1020 aa27.91■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 NAGLUP54802 743 aa27.91■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 TAS2R39P59534 338 aa27.91■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 SLC25A3Q00325 362 aa27.91■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 TSTD2Q5T7W7 516 aa27.91■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 SEL1L3Q68CR1 1132 aa27.91■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 PHTF2Q8N3S3 785 aa27.91■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 SLC25A41Q8N5S1 370 aa27.91■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 GPR152Q8TDT2 470 aa27.91■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 DNAJC9Q8WXX5 260 aa27.91■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 NXNL1Q96CM4 212 aa27.91■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 MAN1C1Q9NR34 630 aa27.91■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 NMRK1Q9NWW6 199 aa27.91■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 SRRDQ9UH36 339 aa27.91■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 CHD5Q8TDI0 1954 aa27.91■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 DRGXA6NNA5 263 aa27.9■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 E9PBE3 544 aa27.9■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 SLCO1B7G3V0H7 640 aa27.9■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 NVLO15381 856 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 DLX3O60479 287 aa27.9■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 KLHL41O60662 606 aa27.9■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 PIGNO95427 931 aa27.9■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 TBX18O95935 607 aa27.9■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 CPB1P15086 417 aa27.9■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 ACADSP16219 412 aa27.9■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 DLG1Q12959 904 aa27.9■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 C1orf146Q5VVC0 180 aa27.9■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa27.9■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 TMC7Q7Z402 723 aa27.9■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 GALNT7Q86SF2 657 aa27.9■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 GPATCH11Q8N954 259 aa27.9■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 IGSF8Q969P0 613 aa27.9■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 PSMG2Q969U7 264 aa27.9■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 GPAMQ9HCL2 828 aa27.9■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 ZBTB14O43829 449 aa27.9■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 FGFR3P22607 806 aa27.9■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 SLC12A2P55011 1212 aa27.9■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 MAXP61244 160 aa27.9■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 ITKQ08881 620 aa27.9■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 ABI1Q8IZP0 508 aa27.9■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 AGR3Q8TD06 166 aa27.9■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 NRG4Q8WWG1 115 aa27.9■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 TADA1Q96BN2 335 aa27.9■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 ZNF333Q96JL9 665 aa27.9■■■□□ 2.06
CERS1-201ENST00000429504 SPATA17Q96L03 361 aa27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms