RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 EFNA5P52803 228 aa4.47□□□□□ -1.69
RBM39-211ENST00000426951 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RBM39-211ENST00000426951 MPP1Q00013 466 aa4.47□□□□□ -1.69
RBM39-211ENST00000426951 RUNX2Q13950 521 aa4.47□□□□□ -1.69
RBM39-211ENST00000426951 VEPH1Q14D04 833 aa4.47□□□□□ -1.69
RBM39-211ENST00000426951 TAF11Q15544 211 aa4.47□□□□□ -1.69
RBM39-211ENST00000426951 TWIST1Q15672 202 aa4.47□□□□□ -1.69
RBM39-211ENST00000426951 ZNF260Q3ZCT1 412 aa4.47□□□□□ -1.69
RBM39-211ENST00000426951 ATG9BQ674R7 924 aa4.47□□□□□ -1.69
RBM39-211ENST00000426951 CES5AQ6NT32 575 aa4.47□□□□□ -1.69
RBM39-211ENST00000426951 KIAA2013Q8IYS2 634 aa4.47□□□□□ -1.69
RBM39-211ENST00000426951 ZMIZ2Q8NF64 920 aa4.47□□□□□ -1.69
RBM39-211ENST00000426951 BICD2Q8TD16 824 aa4.47□□□□□ -1.69
RBM39-211ENST00000426951 SLC35F5Q8WV83 523 aa4.47□□□□□ -1.69
RBM39-211ENST00000426951 RNF183Q96D59 192 aa4.47□□□□□ -1.69
RBM39-211ENST00000426951 MPP4Q96JB8 637 aa4.47□□□□□ -1.69
RBM39-211ENST00000426951 APOLD1Q96LR9 279 aa4.47□□□□□ -1.69
RBM39-211ENST00000426951 KLHL15Q96M94 604 aa4.47□□□□□ -1.69
RBM39-211ENST00000426951 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RBM39-211ENST00000426951 C20orf141Q9NUB4 165 aa4.47□□□□□ -1.69
RBM39-211ENST00000426951 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RBM39-211ENST00000426951 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa4.47□□□□□ -1.69
RBM39-211ENST00000426951 KCND2Q9NZV8 630 aa4.47□□□□□ -1.69
RBM39-211ENST00000426951 KIAA1456Q9P272 454 aa4.47□□□□□ -1.69
RBM39-211ENST00000426951 INSL5Q9Y5Q6 135 aa4.47□□□□□ -1.69
RBM39-211ENST00000426951 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa4.46□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 SH3BP5O60239 455 aa4.46□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 MBD4O95243 580 aa4.46□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 BMP15O95972 392 aa4.46□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 CD4P01730 458 aa4.46□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 IGKV2-30P06310 120 aa4.46□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 ARSBP15848 533 aa4.46□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 SCP2P22307 547 aa4.46□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 DCTDP32321 178 aa4.46□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 ENTPD1P49961 510 aa4.46□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 PMS2P54278 862 aa4.46□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 PTP4A2Q12974 167 aa4.46□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 TRAF1Q13077 416 aa4.46□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 TBC1D26Q86UD7 250 aa4.46□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 PALB2Q86YC2 1186 aa4.46□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 RBFAQ8N0V3 343 aa4.46□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 C11orf65Q8NCR3 313 aa4.46□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 MCPH1Q8NEM0 835 aa4.46□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 NFKBIDQ8NI38 313 aa4.46□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 GPT2Q8TD30 523 aa4.46□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 ASB5Q8WWX0 329 aa4.46□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 TMEM18Q96B42 140 aa4.46□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa4.46□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 USP44Q9H0E7 712 aa4.46□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 CDT1Q9H211 546 aa4.46□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa4.46□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 PLAC1Q9HBJ0 212 aa4.46□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa4.46□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 IRAK4Q9NWZ3 460 aa4.46□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 SARDHQ9UL12 918 aa4.46□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 CD8B2A6NJW9 211 aa4.45□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 EBAG9O00559 213 aa4.45□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 LDLRAD4O15165 306 aa4.45□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 TNFSF14O43557 240 aa4.45□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 LDB2O43679 373 aa4.45□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 TBX18O95935 607 aa4.45□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 TOMM40O96008 361 aa4.45□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 TFPIP10646 304 aa4.45□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 PTPN2P17706 415 aa4.45□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 CD53P19397 219 aa4.45□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 TNFAIP3P21580 790 aa4.45□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 RYKP34925 604 aa4.45□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 THPOP40225 353 aa4.45□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 HARS2P49590 506 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 CLDN2P57739 230 aa4.45□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 ZP1P60852 638 aa4.45□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 NEXNQ0ZGT2 675 aa4.45□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 ZNF284Q2VY69 593 aa4.45□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa4.45□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 AWAT2Q6E213 333 aa4.45□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 NCAPH2Q6IBW4 605 aa4.45□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 Q6ZSV7 163 aa4.45□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 ZNF367Q7RTV3 350 aa4.45□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 CNTROBQ8N137 903 aa4.45□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 TEX45Q8NA69 505 aa4.45□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 TEX19Q8NA77 164 aa4.45□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 KCNG4Q8TDN1 519 aa4.45□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 KLHL29Q96CT2 875 aa4.45□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 UNC45AQ9H3U1 944 aa4.45□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 SMC4Q9NTJ3 1288 aa4.45□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 MPP6Q9NZW5 540 aa4.45□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 ZNF69Q9UC07 566 aa4.45□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 A0A1B0GVT2 93 aa4.44□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 A0A1W2PPH5 198 aa4.44□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 MYMKA6NI61 221 aa4.44□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 HSPB2A8KAH6 182 aa4.44□□□□□ -1.7
RBM39-211ENST00000426951 KLRF2D3W0D1 207 aa4.44□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms