RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 NCEH1Q6PIU2 408 aa17.15■□□□□ 0.34
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TOP3BP1-201ENST00000420768 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa17.15■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 SFTPA1Q8IWL2 248 aa17.15■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 MRGPRX2Q96LB1 330 aa17.15■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 FSD1LQ9BXM9 530 aa17.15■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 PHACTR1Q9C0D0 580 aa17.15■□□□□ 0.34
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TOP3BP1-201ENST00000420768 OR2A12Q8NGT7 310 aa17.14■□□□□ 0.33
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TOP3BP1-201ENST00000420768 GOLGA8MH3BSY2 632 aa17.13■□□□□ 0.33
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 PTPRN2Q92932 1015 aa17.13■□□□□ 0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 IFT43Q96FT9 208 aa17.13■□□□□ 0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 SHDQ96IW2 340 aa17.13■□□□□ 0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 LRIG1Q96JA1 1093 aa17.13■□□□□ 0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 SERPINB12Q96P63 405 aa17.13■□□□□ 0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 HEPHQ9BQS7 1158 aa17.13■□□□□ 0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 EYSQ5T1H1 3165 aa17.13■□□□□ 0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa17.12■□□□□ 0.33
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TOP3BP1-201ENST00000420768 HLA-DPA1P20036 260 aa17.12■□□□□ 0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 SERPINA4P29622 427 aa17.12■□□□□ 0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 BCL2L1Q07817 233 aa17.12■□□□□ 0.33
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TOP3BP1-201ENST00000420768 IHHQ14623 411 aa17.12■□□□□ 0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 PCSK7Q16549 785 aa17.12■□□□□ 0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 IER5LQ5T953 404 aa17.12■□□□□ 0.33
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TOP3BP1-201ENST00000420768 CHPFQ8IZ52 775 aa17.12■□□□□ 0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 FICDQ9BVA6 458 aa17.12■□□□□ 0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 ADGRE3Q9BY15 652 aa17.12■□□□□ 0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARNT2Q9HBZ2 717 aa17.12■□□□□ 0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 CASS4Q9NQ75 786 aa17.12■□□□□ 0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARHGEF3Q9NR81 526 aa17.12■□□□□ 0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 HCN2Q9UL51 889 aa17.12■□□□□ 0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 RAI2Q9Y5P3 530 aa17.12■□□□□ 0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 CHD5Q8TDI0 1954 aa17.11■□□□□ 0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A1W2PQ67 120 aa17.11■□□□□ 0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 SHISA7A6NL88 538 aa17.11■□□□□ 0.33
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