RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415046.6

PTPRK-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-209ENST00000415046 CHD9Q3L8U1 2897 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 UMODL1Q5DID0 1318 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 MROH7Q68CQ1 1323 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 TMEM233B4DJY2 109 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 M0R3H8 397 aa4.81□□□□□ -1.64
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PTPRK-209ENST00000415046 CLTBP09497 229 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 KITP10721 976 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
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PTPRK-209ENST00000415046 CYP3A7P24462 503 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 CIITAP33076 1130 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 EPHB1P54762 984 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 SLC13A2Q13183 592 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 CCNIQ14094 377 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 BECN1Q14457 450 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 PPP2R5AQ15172 486 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 CALCRLQ16602 461 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 UGCGQ16739 394 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 PTCHD3Q3KNS1 767 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 C4orf46Q504U0 113 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 SWSAP1Q6NVH7 229 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 FAM173BQ6P4H8 233 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 MOXD1Q6UVY6 613 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 MPP5Q8N3R9 675 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 LINC01465Q8N7H1 131 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 C16orf52Q8NHV5 167 aa4.81□□□□□ -1.64
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PTPRK-209ENST00000415046 ETNPPLQ8TBG4 499 aa4.81□□□□□ -1.64
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PTPRK-209ENST00000415046 ZBTB10Q96DT7 871 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 C8orf48Q96LL4 319 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 PCYT2Q99447 389 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
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PTPRK-209ENST00000415046 C16orf70Q9BSU1 422 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 KATNAL1Q9BW62 490 aa4.81□□□□□ -1.64
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PTPRK-209ENST00000415046 ZSCAN32Q9NX65 697 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 EMSYQ7Z589 1322 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 NCOR1O75376 2440 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 C17orf102A2RUQ5 167 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 TMEM150BA6NC51 233 aa4.8□□□□□ -1.64
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PTPRK-209ENST00000415046 HAS3O00219 553 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 CES2O00748 559 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 TSPAN6O43657 245 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 STX6O43752 255 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 GCATO75600 419 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 PSMD10O75832 226 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 OR52Z1P0C646 297 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP4.8□□□□□ -1.642e-8■■□□□ 13.2
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PTPRK-209ENST00000415046 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 LMAN2Q12907 356 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 PPFIA1Q13136 1202 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 PLCB4Q15147 1175 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 PTGISQ16647 500 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF260Q3ZCT1 412 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 ANO6Q4KMQ2 910 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 DCAF12L1Q5VU92 463 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 NFRKBQ6P4R8 1299 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 SHC4Q6S5L8 630 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 PTCHD4Q6ZW05 846 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 SPARTQ8N0X7 666 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 NRACQ8N912 160 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 BADQ92934 168 aa4.8□□□□□ -1.64
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