RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403432.5

PUM2-204, Transcript of pumilio RNA binding family member 2, human

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PUM2, Length 3,594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUM2-204	ENST00000403432	RAB10	P61026	200 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	SLC12A1	Q13621	1099 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	PDK3	Q15120	406 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	PCID2	Q5JVF3	399 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	PELI3	Q8N2H9	469 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	CDH9	Q9ULB4	789 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	CFLAR	O15519	480 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	B4GALT3	O60512	393 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	KCNC1	P48547	511 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	SULT2A1	Q06520	285 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	LIN52	Q52LA3	116 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	SCD5	Q86SK9	330 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	SATL1	Q86VE3	508 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	KY	Q8NBH2	561 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	FCRL5	Q96RD9	977 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	PKP2	Q99959	881 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	NMUR1	Q9HB89	426 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	DDHD2	O94830	711 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	TH	P07101	528 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	LHX1	P48742	406 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	VAT1	Q99536	393 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	TLK1	Q9UKI8	766 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	FBP2	O00757	339 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	IRAK2	O43187	625 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	POMC	P01189	267 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	THRA	P10827	490 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	NXN	Q6DKJ4	435 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	RDH11	Q8TC12	318 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	POMK	Q9H5K3	350 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	WDR41	Q9HAD4	459 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	ACOT9	Q9Y305	439 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	MTSS1	O43312	755 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	PGM3	O95394	542 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	CCNC	P24863	283 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	GSTT1	P30711	240 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	HOXC13	P31276	330 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	PLK1	P53350	603 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	PRKAA1	Q13131	559 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	AFMID	Q63HM1	303 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	RANBP10	Q6VN20	620 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	TRPV1	Q8NER1	839 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	OR4Q2	P0C623	313 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	TSPAN8	P19075	237 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	MED21	Q13503	144 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	PCSK7	Q16549	785 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	MMEL1	Q495T6	779 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	NCSTN	Q92542	709 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	RNF34	Q969K3	372 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	CDYL	Q9Y232	598 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PUM2-204	ENST00000403432	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		11.6	□□□□□ -0.55

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