RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354662.5

LMO3-204, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 3,574 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-204ENST00000354662 UGP2Q16851 508 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 GPAT4Q86UL3 456 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 GPIHBP1Q8IV16 184 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 YIPF5Q969M3 257 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 FBXW5Q969U6 566 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 ARL5BQ96KC2 179 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 B3GALT6Q96L58 329 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 TEKT5Q96M29 485 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 JMJD4Q9H9V9 463 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 GABBR1Q9UBS5 961 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 PGAP2Q9UHJ9 254 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 DENND2AQ9ULE3 1009 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 COG5Q9UP83 839 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 SPOPO43791 374 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 SERPINB2P05120 415 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 CALB1P05937 261 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 BMP2P12643 396 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 TSHRP16473 764 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 MMP8P22894 467 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 CRKLP46109 303 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 QARSP47897 775 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 NUMBP49757 651 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 GALEQ14376 348 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 ARMC4Q5T2S8 1044 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 MACC1Q6ZN28 852 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 BBS7Q8IWZ6 715 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 TAS1R2Q8TE23 839 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 C9orf72Q96LT7 481 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 DACH2Q96NX9 599 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 DNAJC28Q9NX36 388 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 APEX2Q9UBZ4 518 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 A0A1B0GWJ7 208 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 B4E1Z4 1266 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 SSX5O60225 188 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 CLN5O75503 358 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 CFBP00751 764 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 SLC4A1P02730 911 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 PSKH1P11801 424 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 ADRA2BP18089 450 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 UQCRC1P31930 480 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 KCNJ1P48048 391 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 FLOT2Q14254 428 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 CTF1Q16619 201 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 PARP15Q460N3 678 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 GLYCTKQ8IVS8 523 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 MICU2Q8IYU8 434 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 TMEM35BQ8NCS4 154 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 MCUQ8NE86 351 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 OR4M1Q8NGD0 313 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 OR2T3Q8NH03 318 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 SLC6A15Q9H2J7 730 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 EFCAB1Q9HAE3 211 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 POLE3Q9NRF9 147 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 F5H6K3 240 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 SNX4O95219 450 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 SPNP16150 400 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 CD53P19397 219 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 RAB3AP20336 220 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 KLRC2P26717 231 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 LRPAP1P30533 357 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 ACTR2P61160 394 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 PLEKHG6Q3KR16 790 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 ATG14Q6ZNE5 492 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 FRMD7Q6ZUT3 714 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 USP51Q70EK9 711 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 RETREG3Q86VR2 466 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 CATSPER3Q86XQ3 398 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 SNX29P2Q8IUI4 249 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 HIPK4Q8NE63 616 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 OR8K5Q8NH50 307 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 LPPQ93052 612 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 HSFY1Q96LI6 401 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 KLHL32Q96NJ5 620 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 IFT46Q9NQC8 304 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 GINS2Q9Y248 185 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 TCP10L2B9ZVM9 353 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 USP12O75317 370 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 SCO1O75880 301 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 SEMA3DO95025 777 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-204ENST00000354662 PDE8BO95263 885 aa8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms