RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343131.6

SYCE1-202, Transcript of synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYCE1, Length 1,113 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1-202ENST00000343131 BRINP1O60477 761 aa16.08■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 ATP1A3P13637 1013 aa16.08■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 NME1P15531 152 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 SLFN11Q7Z7L1 901 aa16.08■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 PARGQ86W56 976 aa16.08■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 AOPEPQ8N6M6 819 aa16.08■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa16.08■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 RFFLQ8WZ73 363 aa16.08■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 FEM1CQ96JP0 617 aa16.08■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 APOLD1Q96LR9 279 aa16.08■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa16.08■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 ERGIC2Q96RQ1 377 aa16.08■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 AGPAT1Q99943 283 aa16.08■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 ANO10Q9NW15 660 aa16.08■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa16.08■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 NLGN3Q9NZ94 848 aa16.08■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 KLF15Q9UIH9 416 aa16.08■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 ASXL3Q9C0F0 2248 aa16.08■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 SHROOM3Q8TF72 1996 aa16.07■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa16.07■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 SIGLEC16A6NMB1 481 aa16.07■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 K7ESM1 405 aa16.07■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 FPGTO14772 594 aa16.07■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 TSPAN6O43657 245 aa16.07■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 KDELR3O43731 214 aa16.07■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 ALPPL2P10696 532 aa16.07■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 CKMT1AP12532 417 aa16.07■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 ITIH2P19823 946 aa16.07■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 ITPKBP27987 946 aa16.07■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 IGFALSP35858 605 aa16.07■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 ABCG1P45844 678 aa16.07■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 RABIFP47224 123 aa16.07■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 RHOAP61586 193 aa16.07■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 OGDHQ02218 1023 aa16.07■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 SGCGQ13326 291 aa16.07■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 NCAPHQ15003 741 aa16.07■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 MYLK3Q32MK0 819 aa16.07■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa16.07■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 VPS36Q86VN1 386 aa16.07■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 RBFAQ8N0V3 343 aa16.07■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 GBP4Q96PP9 640 aa16.07■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 EPAS1Q99814 870 aa16.07■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa16.07■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa16.07■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 TAS2R14Q9NYV8 317 aa16.07■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 RP1P56715 2156 aa16.07■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 KIF26BQ2KJY2 2108 aa16.06■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa16.06■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 ANKRD62A6NC57 917 aa16.06■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 RASA4BC9J798 803 aa16.06■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 AREL1O15033 823 aa16.06■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 INSIG1O15503 277 aa16.06■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 RASA4O43374 803 aa16.06■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 PIGNO95427 931 aa16.06■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 IGSF6O95976 241 aa16.06■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 CSF2P04141 144 aa16.06■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP16.06■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 RTP5Q14D33 572 aa16.06■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 GDPD4Q6W3E5 623 aa16.06■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 DNAAF5Q86Y56 855 aa16.06■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 PLPP6Q8IY26 295 aa16.06■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 RAB7BQ96AH8 199 aa16.06■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 IFT43Q96FT9 208 aa16.06■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 CNPY3Q9BT09 278 aa16.06■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 TTYH3Q9C0H2 523 aa16.06■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 NRSN2Q9GZP1 204 aa16.06■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 RETREG1Q9H6L5 497 aa16.06■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 LHX3Q9UBR4 397 aa16.06■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 FZD10Q9ULW2 581 aa16.06■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa16.06■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 KALRNO60229 2985 aa16.06■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 TMCO5BA8MYB1 307 aa16.05■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 H3BM21 787 aa16.05■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 SCAMP1O15126 338 aa16.05■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 OPA1O60313 960 aa16.05■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 MMP20O60882 483 aa16.05■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 POP4O95707 220 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 MT-CO3P00414 261 aa16.05■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 JUNDP17535 347 aa16.05■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 PFN3P60673 137 aa16.05■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 SERINC3Q13530 473 aa16.05■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 DEFB133Q30KQ1 61 aa16.05■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 DENND6BQ8NEG7 585 aa16.05■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 FAM174AQ8TBP5 190 aa16.05■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 LMX1AQ8TE12 382 aa16.05■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms