RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340994.4

PKHD1-201, Transcript of PKHD1, fibrocystin/polyductin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PKHD1, Length 11,589 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1-201ENST00000340994 ZMYND11Q15326 602 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 VMACQ2NL98 169 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ANO7Q6IWH7 933 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 DEF8Q6ZN54 512 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 CGRRF1Q99675 332 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 OPTCQ9UBM4 332 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 CDH22Q9UJ99 828 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 WDR27A2RRH5 827 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 POMGNT2Q8NAT1 580 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 TMEM260Q9NX78 707 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 PAEPP09466 180 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 GPR1P46091 355 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ITGA7Q13683 1181 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 AUHQ13825 339 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 RHEBQ15382 184 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 RNF220Q5VTB9 566 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 QSOX2Q6ZRP7 698 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 WDR49Q8IV35 697 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 CNTD1Q8N815 330 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 NKX2-3Q8TAU0 364 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 NXNL1Q96CM4 212 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 TBL1YQ9BQ87 522 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 TBC1D24Q9ULP9 559 aa8.3□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 CPS1P31327 1500 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 PARNO95453 639 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 IFNA6P05013 189 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 MAPKAPK3Q16644 382 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 FNBP1LQ5T0N5 605 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 TRIM48Q8IWZ4 208 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ABRAQ8N0Z2 381 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 GMCL1Q96IK5 515 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ITCHQ96J02 903 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF408Q9H9D4 720 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 CXCR2P25025 360 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 SPESP1Q6UW49 350 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 PGAM4Q8N0Y7 254 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ACOX2Q99424 681 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 CST11Q9H112 138 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 LRRC19Q9H756 370 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 RASSF1Q9NS23 344 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 DDIT4Q9NX09 232 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 TULP4Q9NRJ4 1543 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 IQSEC2Q5JU85 1478 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 RB1P06400 928 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ACOT2P49753 483 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 CIAPIN1Q6FI81 312 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 LPCAT1Q8NF37 534 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 USP7Q93009 1102 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 GIT1Q9Y2X7 761 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 SCN8AQ9UQD0 1980 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 PDPK1O15530 556 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 NMT2O60551 498 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 EGFRP00533 1210 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ITGA3P26006 1051 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 IL2P60568 153 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 PTPAQ15257 358 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 OAFQ86UD1 273 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 C7orf26Q96N11 449 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 PCDH18Q9HCL0 1135 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 MAGEB3O15480 346 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 TAF13Q15543 124 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 HTATIP2Q9BUP3 242 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 COX7A2P14406 83 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 RGS7P49802 495 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 MCOLN2Q8IZK6 566 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 HIPK3Q9H422 1215 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 RABL2BQ9UNT1 228 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 GSC2O15499 205 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ERVK-10P10266 1014 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 TAF6P49848 677 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 GSCP56915 257 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 FAM189A2Q15884 450 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF621Q6ZSS3 439 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 MGME1Q9BQP7 344 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms