RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332503.5

HOXB4-201, Transcript of homeobox B4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB4, Length 3,757 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4-201ENST00000332503 GOLGA8OA6NCC3 632 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 GOLGA8NF8WBI6 632 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 NME4O00746 187 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 NRP1O14786 923 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 B4GALT5O43286 388 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 MLH1P40692 756 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 POLD2P49005 469 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 HLCSP50747 726 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 LIMK1P53667 647 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 TMED1Q13445 227 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 OGFOD2Q6N063 350 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 BTLAQ7Z6A9 289 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 PYROXD2Q8N2H3 581 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 TP53INP1Q96A56 240 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 TMEM79Q9BSE2 394 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 PRPSAP2O60256 369 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 SUPT3HO75486 399 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 PIGNO95427 931 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 PSMB4P28070 264 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 IDUAP35475 653 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 MERTKQ12866 999 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 AQP6Q13520 282 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 MFSD4AQ8N468 514 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 A0A087WXM4 84 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 TRIM43BA6NCK2 446 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 M0QYV0 167 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 APOA4P06727 396 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 PRR35P0CG20 571 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 POU5F1BQ06416 359 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 SLC10A6Q3KNW5 377 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 DENND5AQ6IQ26 1287 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 FAM47BQ8NA70 645 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 RNF169Q8NCN4 708 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 NUF2Q9BZD4 464 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 A0A1W2PPW3 197 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 GOT1P17174 413 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 CKMT2P17540 419 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 NELFEP18615 380 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 NME5P56597 212 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 JADE1Q6IE81 842 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 STRADAQ7RTN6 431 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 DEPTORQ8TB45 409 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 UBA3Q8TBC4 463 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 AQP9O43315 295 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 HDCP19113 662 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 UGT1A6P19224 532 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 UGT1A1P22309 533 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 UGT1A4P22310 534 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 OXTRP30559 389 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 UGT1A3P35503 534 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 UGT1A5P35504 534 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 HADHAP40939 763 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 PSMD7P51665 324 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 GRM3Q14832 879 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 RNF148Q8N7C7 305 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 ATP2A3Q93084 1043 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 CGREF1Q99674 301 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 CXorf21Q9HAI6 301 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 C8orf4Q9NR00 106 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 TRPM7Q96QT4 1865 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 AQP12BA6NM10 295 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 LACTBL1A8MY62 500 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 RNF103O00237 685 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 CXCL8P10145 99 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 KCNA5P22460 613 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 HMOX2P30519 316 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 PGGT1BP53609 377 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 PSMD5Q16401 504 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 AQP12AQ8IXF9 295 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 MINDY1Q8N5J2 469 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 C12orf29Q8N999 325 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 CEP70Q8NHQ1 597 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 VMP1Q96GC9 406 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 CDHR1Q96JP9 859 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 APBA2Q99767 749 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 ADI1Q9BV57 179 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 LRRIQ4A6NIV6 560 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 PTPN3P26045 913 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 NDST1P52848 882 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 CTF1Q16619 201 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 IGFN1Q86VF2 1251 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
HOXB4-201ENST00000332503 CANT1Q8WVQ1 401 aa15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms