RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 RMDN2Q96LZ7 410 aa23■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 RAD9AQ99638 391 aa23■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 MGME1Q9BQP7 344 aa23■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 MUC3BQ9H195 1237 aa23■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 SEPT3Q9UH03 358 aa23■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 HEATR9A2RTY3 570 aa23■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 TIMM44O43615 452 aa23■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 C1RP00736 705 aa23■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 RGRP47804 291 aa23■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 SERPINB8P50452 374 aa23■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 MPP1Q00013 466 aa23■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 OVGP1Q12889 678 aa23■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 STXBP5Q5T5C0 1151 aa23■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 Q6ZNB5 142 aa23■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 CNTN4Q8IWV2 1026 aa23■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 CARNMT1Q8N4J0 409 aa23■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 SLC22A17Q8WUG5 538 aa23■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 EXOC2Q96KP1 924 aa23■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 PSKH2Q96QS6 385 aa23■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 PRKD2Q9BZL6 878 aa23■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 KLHL14Q9P2G3 628 aa23■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 DCDC2Q9UHG0 476 aa23■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 A0A1W2PRU2 124 aa22.99■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 TLL1O43897 1013 aa22.99■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 LATS1O95835 1130 aa22.99■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 AHSGP02765 367 aa22.99■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 CKMP06732 381 aa22.99■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 PAMP19021 973 aa22.99■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 DNAJB1P25685 340 aa22.99■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 GRM3Q14832 879 aa22.99■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 PLPP4Q5VZY2 271 aa22.99■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 ALG1LQ6GMV1 187 aa22.99■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC149Q6ZUS6 474 aa22.99■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 BBS5Q8N3I7 341 aa22.99■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 BHMTQ93088 406 aa22.99■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 IFT43Q96FT9 208 aa22.99■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 NSMCE3Q96MG7 304 aa22.99■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 RANBP9Q96S59 729 aa22.99■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 TSSK1BQ9BXA7 367 aa22.99■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 KDM4CQ9H3R0 1056 aa22.99■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa22.99■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 H0Y626 953 aa22.99■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 CTNNB1P35222 781 aa22.99■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 CDK18Q07002 472 aa22.99■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 TSTD2Q5T7W7 516 aa22.99■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 RNF135Q8IUD6 432 aa22.99■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 NOD2Q9HC29 1040 aa22.99■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF358Q9NW07 568 aa22.99■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 OBSL1O75147 1896 aa22.98■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa22.98■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 GSRP00390 522 aa22.98■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 PRKCGP05129 697 aa22.98■■□□□ 1.27
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VSTM4-201ENST00000298454 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
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VSTM4-201ENST00000298454 CYTH1Q15438 398 aa22.98■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 CES4AQ5XG92 561 aa22.98■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 NUDCD3Q8IVD9 361 aa22.98■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 CORO1BQ9BR76 489 aa22.98■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 RHOJQ9H4E5 214 aa22.98■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 NPHS2Q9NP85 383 aa22.98■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM216Q9P0N5 145 aa22.98■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 SIRPGQ9P1W8 387 aa22.98■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa22.98■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 MIA3Q5JRA6 1907 aa22.98■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 CCL16O15467 120 aa22.97■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 SNAP91O60641 907 aa22.97■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 BPGMP07738 259 aa22.97■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 SERPINF2P08697 491 aa22.97■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 MYL4P12829 197 aa22.97■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 BMPR1AP36894 532 aa22.97■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 SLC1A2P43004 574 aa22.97■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 PGGT1BP53609 377 aa22.97■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 ARF5P84085 180 aa22.97■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 CHI3L2Q15782 390 aa22.97■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 SPRED2Q7Z698 418 aa22.97■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 CNPY4Q8N129 248 aa22.97■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 OR13J1Q8NGT2 312 aa22.97■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 FEM1CQ96JP0 617 aa22.97■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa22.97■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 SLC39A10Q9ULF5 831 aa22.97■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 A0A096LPK6 155 aa22.97■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 C2orf71A6NGG8 1288 aa22.97■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 GFRA2O00451 464 aa22.97■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 HGSO14964 777 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 PLIN3O60664 434 aa22.97■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 GLUD1P00367 558 aa22.97■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 SYN1P17600 705 aa22.97■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 SCNN1BP51168 640 aa22.97■■□□□ 1.27
VSTM4-201ENST00000298454 IRF9Q00978 393 aa22.97■■□□□ 1.27
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