RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297316.4

SOX17-201, Transcript of SRY-box 17, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOX17, Length 2,342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17-201ENST00000297316 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 NPHS2Q9NP85 383 aa21.62■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 MYOFQ9NZM1 2061 aa21.61■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 E2F8A0AVK6 867 aa21.61■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 WNT3AP56704 352 aa21.61■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 IRX4P78413 519 aa21.61■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 GALNTL6Q49A17 601 aa21.61■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 FSCBQ5H9T9 825 aa21.61■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 ZNF449Q6P9G9 518 aa21.61■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 KDELC1Q6UW63 502 aa21.61■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 CMC1Q7Z7K0 106 aa21.61■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 SLC25A41Q8N5S1 370 aa21.61■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 ACVR1CQ8NER5 493 aa21.61■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 RFWD2Q8NHY2 731 aa21.61■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 TCEAL4Q96EI5 215 aa21.61■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 RBBP8Q99708 897 aa21.61■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 FSD1LQ9BXM9 530 aa21.61■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 LZTS1Q9Y250 596 aa21.61■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 NOTCH4Q99466 2003 aa21.61■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 CLDN11O75508 207 aa21.61■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 PPM1LQ5SGD2 360 aa21.61■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 DCLK2Q8N568 766 aa21.61■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 FATE1Q969F0 183 aa21.61■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 TSSK1BQ9BXA7 367 aa21.61■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa21.6■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 A0A1B0GVM2 712 aa21.6■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 MAGEB16A2A368 324 aa21.6■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 TCAF2A6NFQ2 919 aa21.6■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 TBL1XO60907 577 aa21.6■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 GSRP00390 522 aa21.6■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 RHOCP08134 193 aa21.6■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 EPCAMP16422 314 aa21.6■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 GRTP1Q5TC63 336 aa21.6■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 Q6ZNB5 142 aa21.6■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 ARRDC2Q8TBH0 407 aa21.6■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 NSMCE1Q8WV22 266 aa21.6■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 SLC46A2Q9BY10 475 aa21.6■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 MAGEH1Q9H213 219 aa21.6■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 MAN1C1Q9NR34 630 aa21.6■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 TXNDC16Q9P2K2 825 aa21.6■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 TRANK1O15050 2925 aa21.6■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 PER2O15055 1255 aa21.6■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 PRKCGP05129 697 aa21.6■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 CA3P07451 260 aa21.6■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 NEFHP12036 1026 aa21.6■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 MNAT1P51948 309 aa21.6■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 PDE1BQ01064 536 aa21.6■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 RANBP10Q6VN20 620 aa21.6■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 WFDC5Q8TCV5 224 aa21.6■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 MCMBPQ9BTE3 642 aa21.6■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 HAUS2Q9NVX0 235 aa21.6■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 CFAP97Q9P2B7 532 aa21.6■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa21.6■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 STOML2Q9UJZ1 356 aa21.6■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 CHKBQ9Y259 395 aa21.6■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 ZNF697Q5TEC3 545 aa21.59■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 TMCO4Q5TGY1 634 aa21.59■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 FSTL4Q6MZW2 842 aa21.59■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 PKN3Q6P5Z2 889 aa21.59■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 ELMOD1Q8N336 334 aa21.59■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 CARNMT1Q8N4J0 409 aa21.59■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 SEMA3CQ99985 751 aa21.59■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 ASAH2Q9NR71 780 aa21.59■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 SNX15Q9NRS6 342 aa21.59■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 SIRPGQ9P1W8 387 aa21.59■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 DCTN4Q9UJW0 460 aa21.59■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 REV3LO60673 3130 aa21.59■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 LIMK2P53671 638 aa21.58■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 PCID2Q5JVF3 399 aa21.58■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 RNF135Q8IUD6 432 aa21.58■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 ACMSDQ8TDX5 336 aa21.58■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 CAB39LQ9H9S4 337 aa21.58■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 ATP13A1Q9HD20 1204 aa21.58■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 ZNF358Q9NW07 568 aa21.58■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 NUMBLQ9Y6R0 609 aa21.58■■□□□ 1.05
SOX17-201ENST00000297316 CBX4O00257 560 aa21.58■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 C1RP00736 705 aa21.58■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 ARNTP27540 789 aa21.58■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 MPP3Q13368 585 aa21.58■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 ZNF235Q14590 738 aa21.58■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 DLG2Q15700 870 aa21.58■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 CHST9Q7L1S5 443 aa21.58■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 BBS7Q8IWZ6 715 aa21.58■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 EXOC2Q96KP1 924 aa21.58■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 NSMCE3Q96MG7 304 aa21.58■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 PLCD4Q9BRC7 762 aa21.58■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 CERS4Q9HA82 394 aa21.58■■□□□ 1.04
SOX17-201ENST00000297316 PLK2Q9NYY3 685 aa21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms