RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 DPYSL5Q9BPU6 564 aa8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 DDIT4Q9NX09 232 aa8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP4R2Q9NY27 417 aa8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 KLF15Q9UIH9 416 aa8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 VANGL2Q9ULK5 521 aa8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 MYO9AB2RTY4 2548 aa7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 IGLON5A6NGN9 336 aa7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 EFCAB7A8K855 629 aa7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 C9orf172C9J069 976 aa7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 ADCY5O95622 1261 aa7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 DDAH2O95865 285 aa7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 NUMBP49757 651 aa7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB15P59190 212 aa7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 MEA1Q16626 185 aa7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 CARD16Q5EG05 197 aa7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 EFHC1Q5JVL4 640 aa7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 SYPL2Q5VXT5 272 aa7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 ATL3Q6DD88 541 aa7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 RD3Q7Z3Z2 195 aa7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 VPS36Q86VN1 386 aa7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 KYQ8NBH2 561 aa7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 AGBL5Q8NDL9 886 aa7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 CLEC4CQ8WTT0 213 aa7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 NKD1Q969G9 470 aa7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 MIB2Q96AX9 1013 aa7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 MOCOSQ96EN8 888 aa7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 ALG14Q96F25 216 aa7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 PAGE5Q96GU1 130 aa7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC45A3Q96JT2 553 aa7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 DDA1Q9BW61 102 aa7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 ZMYND15Q9H091 742 aa7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 PRDM8Q9NQV8 689 aa7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 RRN3Q9NYV6 651 aa7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 FOXJ2Q9P0K8 574 aa7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 COX16Q9P0S2 106 aa7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 KLQ9UEF7 1012 aa7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 VPS51Q9UID3 782 aa7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 CFAP45Q9UL16 551 aa7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 HPCAL4Q9UM19 191 aa7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 PLAAQ9Y263 795 aa7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 COQ4Q9Y3A0 265 aa7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 KCTD3Q9Y597 815 aa7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF215Q9Y6U7 377 aa7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 DOCK9Q9BZ29 2069 aa7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 KIF26BQ2KJY2 2108 aa7.99□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 RP1P56715 2156 aa7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 CREBBPQ92793 2442 aa7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1W2PQM1 296 aa7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 PRR19A6NJB7 356 aa7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 C16orf96A6NNT2 1141 aa7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 RAD51BO15315 384 aa7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 INPP4BO15327 924 aa7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 SPINT1O43278 529 aa7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 KLRC4O43908 158 aa7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 HSF2BPO75031 334 aa7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 FYNP06241 537 aa7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 RRM1P23921 792 aa7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 VARSP26640 1264 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 OR1E1P30953 314 aa7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 SUOXP51687 545 aa7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 ELP6Q0PNE2 266 aa7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 CUL4AQ13619 759 aa7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 C14orf28Q4W4Y0 310 aa7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF805Q5CZA5 627 aa7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 CERCAMQ5T4B2 595 aa7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 DCAF12Q5T6F0 453 aa7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 RESP18Q5W5W9 173 aa7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 ENPP7Q6UWV6 458 aa7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 TAF8Q7Z7C8 310 aa7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 TTC7BQ86TV6 843 aa7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 PLPP6Q8IY26 295 aa7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 PPM1KQ8N3J5 372 aa7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 CHST14Q8NCH0 376 aa7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 GALNT11Q8NCW6 608 aa7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM46DQ8NEK8 389 aa7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 SPOCK2Q92563 424 aa7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms