RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000280780.6

FAM53B-201, Transcript of family with sequence similarity 53 member B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM53B, Length 1,568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53B-201ENST00000280780 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa22.65■■□□□ 1.22
FAM53B-201ENST00000280780 EXOC2Q96KP1 924 aa22.65■■□□□ 1.22
FAM53B-201ENST00000280780 HINFPQ9BQA5 517 aa22.65■■□□□ 1.22
FAM53B-201ENST00000280780 ARFGAP3Q9NP61 516 aa22.65■■□□□ 1.22
FAM53B-201ENST00000280780 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa22.65■■□□□ 1.22
FAM53B-201ENST00000280780 SEPT3Q9UH03 358 aa22.65■■□□□ 1.22
FAM53B-201ENST00000280780 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
FAM53B-201ENST00000280780 FANCMQ8IYD8 2048 aa22.65■■□□□ 1.22
FAM53B-201ENST00000280780 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
FAM53B-201ENST00000280780 TIMM44O43615 452 aa22.64■■□□□ 1.22
FAM53B-201ENST00000280780 ATP9BO43861 1147 aa22.64■■□□□ 1.22
FAM53B-201ENST00000280780 OPHN1O60890 802 aa22.64■■□□□ 1.22
FAM53B-201ENST00000280780 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
FAM53B-201ENST00000280780 STK10O94804 968 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
FAM53B-201ENST00000280780 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
FAM53B-201ENST00000280780 NFKB1P19838 968 aa22.64■■□□□ 1.22
FAM53B-201ENST00000280780 VASPP50552 380 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
FAM53B-201ENST00000280780 ZNF235Q14590 738 aa22.64■■□□□ 1.22
FAM53B-201ENST00000280780 MAP9Q49MG5 647 aa22.64■■□□□ 1.22
FAM53B-201ENST00000280780 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
FAM53B-201ENST00000280780 PID1Q7Z2X4 250 aa22.64■■□□□ 1.22
FAM53B-201ENST00000280780 FRS2Q8WU20 508 aa22.64■■□□□ 1.22
FAM53B-201ENST00000280780 NSMCE3Q96MG7 304 aa22.64■■□□□ 1.22
FAM53B-201ENST00000280780 FERMT1Q9BQL6 677 aa22.64■■□□□ 1.22
FAM53B-201ENST00000280780 MGME1Q9BQP7 344 aa22.64■■□□□ 1.22
FAM53B-201ENST00000280780 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
FAM53B-201ENST00000280780 TRHDEQ9UKU6 1024 aa22.64■■□□□ 1.22
FAM53B-201ENST00000280780 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
FAM53B-201ENST00000280780 TTLL3Q9Y4R7 772 aa22.64■■□□□ 1.22
FAM53B-201ENST00000280780 CKAP5Q14008 2032 aa22.64■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 TTC34A8MYJ7 566 aa22.63■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 MYBL2P10244 700 aa22.63■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 CR2P20023 1033 aa22.63■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 IVDP26440 423 aa22.63■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 PSMB4P28070 264 aa22.63■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 FNTBP49356 437 aa22.63■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 NIPAL4Q0D2K0 466 aa22.63■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 ZNF234Q14588 700 aa22.63■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 CRY1Q16526 586 aa22.63■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 ZNF528Q3MIS6 628 aa22.63■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 FAXCQ5TGI0 409 aa22.63■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 C22orf39Q6P5X5 142 aa22.63■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP22.63■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 VOPP1Q96AW1 172 aa22.63■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 GBA3Q9H227 469 aa22.63■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 TNKS2Q9H2K2 1166 aa22.63■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 MTG2Q9H4K7 406 aa22.63■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 GLOD4Q9HC38 313 aa22.63■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 CD248Q9HCU0 757 aa22.63■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 SLC8A2Q9UPR5 921 aa22.63■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 EML5Q05BV3 1969 aa22.63■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 DSC2Q02487 901 aa22.63■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 GPS1Q13098 491 aa22.63■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 DLG2Q15700 870 aa22.63■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 ALG1LQ6GMV1 187 aa22.63■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 KIAA1211LQ6NV74 962 aa22.63■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa22.63■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 NUDT18Q6ZVK8 323 aa22.63■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 ZNF366Q8N895 744 aa22.63■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 ARRDC2Q8TBH0 407 aa22.63■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 TM6SF2Q9BZW4 377 aa22.63■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 TMEM245Q9H330 911 aa22.63■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 FAM114A2Q9NRY5 505 aa22.63■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 PAK5Q9P286 719 aa22.63■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 A0A1W2PQF6 199 aa22.62■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 MMP2P08253 660 aa22.62■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 NTSR1P30989 418 aa22.62■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 IL12RB1P42701 662 aa22.62■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 CARSP49589 748 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 RHOAP61586 193 aa22.62■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 TRADDQ15628 312 aa22.62■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 Q6ZVU0 165 aa22.62■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 ZBTB44Q8NCP5 570 aa22.62■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 KCNV2Q8TDN2 545 aa22.62■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 TRIM31Q9BZY9 425 aa22.62■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 CEP44Q9C0F1 390 aa22.62■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 ZNF446Q9NWS9 450 aa22.62■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 ASIC3Q9UHC3 531 aa22.62■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 RSPH14Q9UHP6 348 aa22.62■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 HLA-EP13747 358 aa22.61■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 PRKCHP24723 683 aa22.61■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 RPL21P46778 160 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 CHPFQ8IZ52 775 aa22.61■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 SPATA22Q8NHS9 363 aa22.61■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 UCMAQ8WVF2 138 aa22.61■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 SEMA3CQ99985 751 aa22.61■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 FAM129AQ9BZQ8 928 aa22.61■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 PLA2G4CQ9UP65 541 aa22.61■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 STON1Q9Y6Q2 735 aa22.61■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
FAM53B-201ENST00000280780 ESYT3A0FGR9 886 aa22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms