RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273261.7

LRIG1-201, Transcript of leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRIG1, Length 5,273 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1-201ENST00000273261 GRK4P32298 578 aa20.55■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 CDK20Q8IZL9 346 aa20.55■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 SELENOMQ8WWX9 145 aa20.55■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 SNX8Q9Y5X2 465 aa20.55■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 CLOCKO15516 846 aa20.55■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 LRCH4O75427 683 aa20.55■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 PDE5AO76074 875 aa20.55■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 EPN2O95208 641 aa20.55■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 POLD2P49005 469 aa20.55■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 WNT3AP56704 352 aa20.55■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 EPS8Q12929 822 aa20.55■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 SLC24A5Q71RS6 500 aa20.55■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa20.55■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 DDHD1Q8NEL9 900 aa20.55■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 TRMOQ9BU70 441 aa20.55■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 RHOJQ9H4E5 214 aa20.55■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 KLHL20Q9Y2M5 609 aa20.55■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 CST3P01034 146 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 FTH1P02794 183 aa20.55■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 PTPRNQ16849 979 aa20.55■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 ZNF614Q8N883 585 aa20.55■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 RNF145Q96MT1 663 aa20.55■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 PIF1Q9H611 641 aa20.55■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 SERPINA6P08185 405 aa20.54■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 IL5RAQ01344 420 aa20.54■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 TEX44Q53QW1 395 aa20.54■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 FAM228AQ86W67 206 aa20.54■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 KCTD4Q8WVF5 259 aa20.54■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 USE1Q9NZ43 259 aa20.54■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 KLQ9UEF7 1012 aa20.54■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa20.54■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 CLDN11O75508 207 aa20.54■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 BANF1O75531 89 aa20.54■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 FGF19O95750 216 aa20.54■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 CACNA2D1P54289 1103 aa20.54■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 DDR2Q16832 855 aa20.54■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 PARP15Q460N3 678 aa20.54■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa20.54■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 ERVK-5Q9HDB9 667 aa20.54■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 SGTAO43765 313 aa20.54■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 CDC25CP30307 473 aa20.54■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 CDKN2BP42772 138 aa20.54■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 OLFML2BQ68BL8 750 aa20.54■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 CXorf40AQ8TE69 158 aa20.54■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 ELMO1Q92556 727 aa20.54■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 INVSQ9Y283 1065 aa20.54■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 RGSL1A5PLK6 1076 aa20.54■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 GSTM1P09488 218 aa20.54■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 COX4I1P13073 169 aa20.54■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 ABL2P42684 1182 aa20.54■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 RFX3P48380 749 aa20.54■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa20.54■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 BBS2Q9BXC9 721 aa20.54■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa20.54■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 DYTNA2CJ06 578 aa20.53■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 ANAPC2Q9UJX6 822 aa20.53■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 GRM3Q14832 879 aa20.53■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 IRGCQ6NXR0 463 aa20.53■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 OR4L1Q8NH43 312 aa20.53■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 BTN2A2Q8WVV5 523 aa20.53■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 BBS4Q96RK4 519 aa20.53■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 HPS4Q9NQG7 708 aa20.53■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 COPG2Q9UBF2 871 aa20.53■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 COG5Q9UP83 839 aa20.53■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 COQ4Q9Y3A0 265 aa20.53■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 FLT3P36888 993 aa20.53■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 RPL3P39023 403 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 TRPC4APQ8TEL6 797 aa20.53■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 SLC44A1Q8WWI5 657 aa20.53■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP20.53■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 TBC1D3BA6NDS4 549 aa20.53■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 SOWAHBA6NEL2 793 aa20.53■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 COL6A2P12110 1019 aa20.53■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 COX7A2P14406 83 aa20.53■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 CORO1BQ9BR76 489 aa20.53■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 ATG7O95352 703 aa20.52■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 OTCP00480 354 aa20.52■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 CCDC142Q17RM4 750 aa20.52■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa20.52■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 DHRSXQ8N5I4 330 aa20.52■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 GLMNQ92990 594 aa20.52■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 SNX27Q96L92 541 aa20.52■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa20.52■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 SLC28A1O00337 649 aa20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms