RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259154.8

KCTD3-201, Transcript of potassium channel tetramerization domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCTD3, Length 3,931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD3-201ENST00000259154 CNTFP26441 200 aa15□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 TIGD2Q4W5G0 525 aa15□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 BRSK2Q8IWQ3 736 aa15□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 ATG16L2Q8NAA4 619 aa15□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 SLC2A14Q8TDB8 520 aa15□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 TRPC4APQ8TEL6 797 aa15□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 RORBQ92753 470 aa15□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 BORCS5Q969J3 196 aa15□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 TAMM41Q96BW9 452 aa15□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 VPS51Q9UID3 782 aa15□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 KIF13BQ9NQT8 1826 aa15□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 MTA2O94776 668 aa15□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 RHOBTB1O94844 696 aa15□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 KCTD8Q6ZWB6 473 aa15□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 AP5M1Q9H0R1 490 aa15□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa15□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa15□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 EBF1Q9UH73 591 aa15□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 A8MU76 341 aa14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 H0Y858 1186 aa14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 SEC24AO95486 1093 aa14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 ASS1P00966 412 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 EDN1P05305 212 aa14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 NFKB1P19838 968 aa14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 C11orf91Q3C1V1 193 aa14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 GRTP1Q5TC63 336 aa14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 FSTL4Q6MZW2 842 aa14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 MOB2Q70IA6 237 aa14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 GALNT5Q7Z7M9 940 aa14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 FNDC5Q8NAU1 212 aa14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 FBXL20Q96IG2 436 aa14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 BTBD9Q96Q07 612 aa14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 CPNE1Q99829 537 aa14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 LATS2Q9NRM7 1088 aa14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 ASB3Q9Y575 518 aa14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 CITO14578 2027 aa14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 A0A0A0MRY4 1105 aa14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 GRIN3BO60391 1043 aa14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 GRM3Q14832 879 aa14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 MPZL3Q6UWV2 235 aa14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 PAGE2Q7Z2X7 111 aa14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 SLCO6A1Q86UG4 719 aa14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 VSIG10LQ86VR7 867 aa14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 SNX29P2Q8IUI4 249 aa14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 SPATA13Q96N96 652 aa14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 NAT9Q9BTE0 207 aa14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 CEP44Q9C0F1 390 aa14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 WDCPQ9H6R7 721 aa14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 RAP2CQ9Y3L5 183 aa14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 E7ENX8 843 aa14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 EI24O14681 340 aa14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 VNN1O95497 513 aa14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 PIGFQ07326 219 aa14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 DEPDC1Q5TB30 811 aa14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 TAS1R3Q7RTX0 852 aa14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 APPL2Q8NEU8 664 aa14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 DMRTB1Q96MA1 342 aa14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 PPM1MQ96MI6 270 aa14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 HAPLN2Q9GZV7 340 aa14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 HMG20AQ9NP66 347 aa14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 RASSF1Q9NS23 344 aa14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP14.99□□□□□ -0.013e-6■■■■□ 26.1
KCTD3-201ENST00000259154 SCN3BQ9NY72 215 aa14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 TIMM22Q9Y584 194 aa14.99□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 NDUFB5O43674 189 aa14.98□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 HGFP14210 728 aa14.98□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 INHBCP55103 352 aa14.98□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 TGFB2P61812 414 aa14.98□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 MPP1Q00013 466 aa14.98□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 NR6A1Q15406 480 aa14.98□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 DENND6AQ8IWF6 608 aa14.98□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 CHST13Q8NET6 341 aa14.98□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 PCDH19Q8TAB3 1148 aa14.98□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 TCF12Q99081 682 aa14.98□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 C9orf16Q9BUW7 83 aa14.98□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 SLC25A23Q9BV35 468 aa14.98□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 KANSL3Q9P2N6 904 aa14.98□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa14.98□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 CPA4Q9UI42 421 aa14.98□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP14.98□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 ASB14A6NK59 587 aa14.98□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 BIRC5O15392 142 aa14.98□□□□□ -0.01
KCTD3-201ENST00000259154 GUCA1CO95843 209 aa14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms