RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000018810.9

Cbx1-201, Transcript of Chromobox protein homolog 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Cbx1, Length 1,824 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Serpinb6cW4VSP4 379 aa18.45■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 SpaarA0A1B0GSZ0 75 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Lonrf2B2RT44 518 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Zfp963D3Z2T8 383 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rap1gds1E9Q912 607 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ptch2O35595 1182 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Diaph2O70566 1098 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 CkmP07310 381 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 MipP51180 263 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ptprn2P80560 1001 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Arf5P84084 180 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Prss53Q571E5 552 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Zdhhc18Q5Y5T2 380 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Znf148Q61624 794 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 CcncQ62447 283 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Inpp4bQ6P1Y8 924 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tecpr1Q80VP0 1166 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 NfascQ810U3 1240 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tbc1d17Q8BYH7 645 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Def6Q8C2K1 630 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fam204aQ8C6C7 236 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 KmoQ91WN4 479 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Acot13Q9CQR4 140 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Nkx2-4Q9EQM3 354 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Aldh1a3Q9JHW9 512 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pcsk5Q04592 1877 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Myo10F8VQB6 2062 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 OtofQ9ESF1 1997 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm29554A0A087WNW4 188 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cilp2D3Z7H8 1162 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Morc3F7BJB9 942 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Exoc7O35250 697 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 PdgfrbP05622 1098 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rc3h2P0C090 1187 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Sbk3P0C5K0 361 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Prdx3P20108 257 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gja1P23242 382 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Trim43bP86448 445 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Creb1Q01147 341 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Colec11Q3SXB8 272 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gpatch4Q3TFK5 415 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Naf1Q3UMQ8 489 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Zbtb16Q3UQ17 673 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Q3V0E1 1183 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ccdc185Q3V118 621 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Nxpe4Q52KP5 543 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Sdf4Q61112 361 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Lingo3Q6GQU6 589 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Zfp454Q80Y34 536 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Zbtb41Q811F1 908 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cox14Q8BH51 57 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Zfp595Q8BIN6 625 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fzd10Q8BKG4 582 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cplx3Q8R1B5 158 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Olfr665Q8VG79 316 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Olfr342Q8VGK7 312 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Duoxa2Q9D311 320 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 1700109H08RikQ9D9C0 210 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gkap1Q9JMB0 366 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cacna2d3Q9Z1L5 1091 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Htatip2Q9Z2G9 242 aa18.44■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm21964A0A1W2P7S4 437 aa18.43■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Slc22a2O70577 553 aa18.43■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 P01670 111 aa18.43■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 P01671 111 aa18.43■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 P01672 111 aa18.43■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fgf13P70377 245 aa18.43■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Krt77Q6IFZ6 572 aa18.43■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Hmgb4Q6P8W9 181 aa18.43■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Als2cr12Q8BVM7 383 aa18.43■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Proser2Q8C5R2 471 aa18.43■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tmem82Q8R115 356 aa18.43■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Art3Q8R2G4 371 aa18.43■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Nup85Q8R480 656 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ssu72Q9CY97 194 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 4930578G10RikQ9D4Q4 153 aa18.43■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pard6bQ9JK83 371 aa18.43■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cyth1Q9QX11 398 aa18.43■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Clec4aQ9QZ15 238 aa18.43■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Trpm6Q8CIR4 2028 aa18.43■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pcm1Q9R0L6 2025 aa18.43■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Olfr663A0A1B0GSI9 319 aa18.42■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Got2P05202 430 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 RargP18911 458 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cxcl17Q5UW37 119 aa18.42■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Nomo1Q6GQT9 1214 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cplx4Q80WM3 160 aa18.42■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Znf76Q8BMU0 568 aa18.42■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 B130006D01RikQ8BRH6 153 aa18.42■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pih1h3bQ8C6P5 218 aa18.42■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Trip10Q8CJ53 603 aa18.42■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ppp4r1Q8K2V1 951 aa18.42■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Defb36Q8K3U4 67 aa18.42■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 ItpkaQ8R071 459 aa18.42■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Dhrs1Q99L04 313 aa18.42■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ttyh1Q9D3A9 450 aa18.42■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Exoc2Q9D4H1 924 aa18.42■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Stap1Q9JM90 297 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Dio2Q9Z1Y9 266 aa18.42■□□□□ 0.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 4933424G06RikA0A140LIP3 267 aa18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 48 ms