RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 THOP1P52888 689 aa27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 ADKP55263 362 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 DEUP1Q05D60 604 aa27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 NFATC3Q12968 1075 aa27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 SPIDRQ14159 915 aa27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 CARD16Q5EG05 197 aa27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 PRRT3Q5FWE3 981 aa27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM81BQ96LP2 452 aa27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM117AQ9C073 453 aa27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 CEP44Q9C0F1 390 aa27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 RRN3Q9NYV6 651 aa27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 SPINT1O43278 529 aa27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 AP1G1O43747 822 aa27.86■■■□□ 2.05
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CAPNS1-217ENST00000629983 ANXA6P08133 673 aa27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 CXCR3P49682 368 aa27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 ZSCAN30Q86W11 494 aa27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 CREBRFQ8IUR6 639 aa27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC35F3Q8IY50 421 aa27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 WDR48Q8TAF3 677 aa27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC3Q9BQI4 270 aa27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
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CAPNS1-217ENST00000629983 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 PCDHGC3Q9UN70 934 aa27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 DRGXA6NNA5 263 aa27.85■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 KRT9P35527 623 aa27.85■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 PTPN20Q4JDL3 420 aa27.85■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM65Q6PJ69 517 aa27.85■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 CLEC14AQ86T13 490 aa27.85■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 JAMLQ86YT9 394 aa27.85■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF683Q8IZ20 524 aa27.85■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 PHACTR4Q8IZ21 702 aa27.85■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 NPY6RQ99463 290 aa27.85■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa27.85■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa27.85■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 ITM2BQ9Y287 266 aa27.85■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 ILVBLA1L0T0 632 aa27.84■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa27.84■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 CASC3O15234 703 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
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CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 PTK2Q05397 1052 aa27.84■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC20A2Q08357 652 aa27.84■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 PTK2BQ14289 1009 aa27.84■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa27.84■■■□□ 2.05
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CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 OR6K2Q8NGY2 324 aa27.84■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 TIGD1Q96MW7 591 aa27.84■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 BOCQ9BWV1 1114 aa27.84■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC13A1Q9BZW2 595 aa27.84■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM4Q9C037 500 aa27.84■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 EPB41L5Q9HCM4 733 aa27.84■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 DOLKQ9UPQ8 538 aa27.84■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 I6L893 689 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 GCATO75600 419 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 F9P00740 461 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 ITGA2BP08514 1039 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 ABL2P42684 1182 aa27.83■■■□□ 2.05
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CAPNS1-217ENST00000629983 PAK1Q13153 545 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 FAXCQ5TGI0 409 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 DRC7Q8IY82 874 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 TBCBQ99426 244 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 PLCB1Q9NQ66 1216 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 GULP1Q9UBP9 304 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 GGT7Q9UJ14 662 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 PADI4Q9UM07 663 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 C16orf96A6NNT2 1141 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-217ENST00000629983 BIN1O00499 593 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC9A1P19634 815 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-217ENST00000629983 GKP32189 559 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-217ENST00000629983 ARL13BQ3SXY8 428 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-217ENST00000629983 FOXR2Q6PJQ5 311 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF783Q6ZMS7 281 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-217ENST00000629983 VPS36Q86VN1 386 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB7BQ96AH8 199 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC61Q9BV99 259 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-217ENST00000629983 PDCL3Q9H2J4 239 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-217ENST00000629983 APEX2Q9UBZ4 518 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-217ENST00000629983 ACTL7AQ9Y615 435 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-217ENST00000629983 HECTD1Q9ULT8 2610 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-217ENST00000629983 LMO7DNF2Z398 122 aa27.81■■■□□ 2.04
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