RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 ASNSD1Q9NWL6 643 aa11.88□□□□□ -0.51
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CAPNS1-209ENST00000590049 DUSP10Q9Y6W6 482 aa11.87□□□□□ -0.51
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CAPNS1-209ENST00000590049 RALAP11233 206 aa11.86□□□□□ -0.51
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CAPNS1-209ENST00000590049 POPDC2Q9HBU9 364 aa11.86□□□□□ -0.51
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CAPNS1-209ENST00000590049 ENTPD4Q9Y227 616 aa11.86□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 USP3Q9Y6I4 520 aa11.86□□□□□ -0.51
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CAPNS1-209ENST00000590049 PALMO75781 387 aa11.85□□□□□ -0.51
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CAPNS1-209ENST00000590049 PDGFRAP16234 1089 aa11.85□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 PFKLP17858 780 aa11.85□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 WT1P19544 449 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
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CAPNS1-209ENST00000590049 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP11.85□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 PM20D1Q6GTS8 502 aa11.85□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 C11orf63Q6NUN7 778 aa11.85□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 ARCQ7LC44 396 aa11.85□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 PEX26Q7Z412 305 aa11.85□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 CACUL1Q86Y37 369 aa11.85□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 FNIP1Q8TF40 1166 aa11.85□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 CLEC4CQ8WTT0 213 aa11.85□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa11.85□□□□□ -0.51
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