RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588413.5

TMUB2-210, Transcript of transmembrane and ubiquitin like domain containing 2, human

TSL 2

Gene TMUB2, Length 747 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMUB2-210	ENST00000588413	MAP3K13	O43283	966 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	BNIP3L	O60238	219 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	DNTT	P04053	509 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	ITGAV	P06756	1048 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	OXTR	P30559	389 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	XRCC4	Q13426	336 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	CYTH1	Q15438	398 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	ELF2	Q15723	593 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413		Q6ZVU0	165 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	C11orf74	Q86VG3	221 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	RFX6	Q8HWS3	928 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	ATL2	Q8NHH9	583 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	RLN3	Q8WXF3	142 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	HAUS1	Q96CS2	278 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	SP110	Q9HB58	689 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	PDF	Q9HBH1	243 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	RAB21	Q9UL25	225 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	INVS	Q9Y283	1065 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	CCDC151	A5D8V7	595 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	BHMG1	C9JSJ3	638 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	LIAS	O43766	372 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	ECEL1	O95672	775 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	IL1B	P01584	269 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	KRT10	P13645	584 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	SLC8A1	P32418	973 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	P2RY2	P41231	377 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	NHLH1	Q02575	133 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	CUL1	Q13616	776 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	BRD3	Q15059	726 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	NOMO1	Q15155	1222 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	KAZN	Q674X7	775 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	CEP68	Q76N32	757 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	IFT20	Q8IY31	132 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	PLD5	Q8N7P1	536 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	TMIE	Q8NEW7	156 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	ACTL9	Q8TC94	416 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	P3H4	Q92791	437 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	ZNF599	Q96NL3	588 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	HACD1	B0YJ81	288 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	PROB1	E7EW31	1015 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	RAD51C	O43502	376 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	MAFK	O60675	156 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	TMCC1	O94876	653 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	GSR	P00390	522 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	MX2	P20592	715 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	C5AR1	P21730	350 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	CCNC	P24863	283 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	TPMT	P51580	245 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	RHOA	P61586	193 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	ZNF33A	Q06730	810 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	GALNT2	Q10471	571 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	CST6	Q15828	149 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	MYLK3	Q32MK0	819 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	TTC27	Q6P3X3	843 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	FRMD1	Q8N878	549 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMUB2-210	ENST00000588413	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21

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