RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 PRKCQQ04759 706 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 MTM1Q13496 603 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM78AQ5JUQ0 283 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 ATG16L1Q676U5 607 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 ASRGL1Q7L266 308 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 LEMD2Q8NC56 503 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 ZSWIM3Q96MP5 696 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 GBA3Q9H227 469 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 SAR1AQ9NR31 198 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 POLBP06746 335 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 NQO1P15559 274 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 PSMB4P28070 264 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 NPY2RP49146 381 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 ASCL5Q7RTU5 278 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 PID1Q7Z2X4 250 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 PARP9Q8IXQ6 854 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 MPP5Q8N3R9 675 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 ATAD1Q8NBU5 361 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 OR10T2Q8NGX3 314 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 ASB16Q96NS5 453 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 TSSK1BQ9BXA7 367 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 LRRC40Q9H9A6 602 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 COX16Q9P0S2 106 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 COL4A3Q01955 1670 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 KANSL1LA0AUZ9 987 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 MTMR11A4FU01 709 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 GOLGA8RI6L899 631 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 GARSP41250 739 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 RASSF2P50749 326 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 INSCQ1MX18 579 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 SYCP2LQ5T4T6 812 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 LRRC49Q8IUZ0 686 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 SPOCK2Q92563 424 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 INPP5DQ92835 1189 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 C7orf26Q96N11 449 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM111AQ96PZ2 611 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 CASS4Q9NQ75 786 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 ASAH2Q9NR71 780 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 OR12D3Q9UGF7 316 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 DMDP11532 3685 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM72CH0Y354 149 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 BDNFP23560 247 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 PPP2R5DQ14738 602 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 CRYMQ14894 314 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 TEX44Q53QW1 395 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM72AQ5TYM5 149 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 KCTD11Q693B1 232 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM72DQ6L9T8 149 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 TAC4Q86UU9 113 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM72BQ86X60 149 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 TMC8Q8IU68 726 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 KLHL29Q96CT2 875 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM237Q96Q45 408 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 TKTL2Q9H0I9 626 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 ZFP14Q9HCL3 533 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 BFARQ9NZS9 450 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 SIRPGQ9P1W8 387 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 HSFX1Q9UBD0 423 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 PTPRDP23468 1912 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 SHISA7A6NL88 538 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 IRAK2O43187 625 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 CACNG3O60359 315 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 MYL4P12829 197 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 GJA1P17302 382 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 PLD1Q13393 1074 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 SNCBQ16143 134 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 TTC9BQ8N6N2 239 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 SHKBP1Q8TBC3 707 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 SMARCD2Q92925 531 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 TRPV4Q9HBA0 871 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 CHKBQ9Y259 395 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 PRR23AA6NEV1 266 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-204ENST00000587718 I6L893 689 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-204ENST00000587718 DNAJC6O75061 913 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-204ENST00000587718 MGAT1P26572 445 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-204ENST00000587718 GRIA1P42261 906 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-204ENST00000587718 PRPSAP1Q14558 356 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM91A1Q658Y4 838 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-204ENST00000587718 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-204ENST00000587718 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-204ENST00000587718 ISL2Q96A47 359 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-204ENST00000587718 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-204ENST00000587718 OSBPL6Q9BZF3 934 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-204ENST00000587718 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms