RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585907.1

PRKAR1A-209, Transcript of protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit alpha, human

TSL 2

Gene PRKAR1A, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKAR1A-209	ENST00000585907	RAD23B	P54727	409 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	GFRA1	P56159	465 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	CETN1	Q12798	172 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	TAF10	Q12962	218 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	CUL2	Q13617	745 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	RUNX3	Q13761	415 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	LRRC32	Q14392	662 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	MTF1	Q14872	753 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	ANGPT1	Q15389	498 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	STIL	Q15468	1287 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	NRN1L	Q496H8	165 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	RAB41	Q5JT25	222 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	PAF1	Q8N7H5	531 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	C12orf29	Q8N999	325 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	STKLD1	Q8NE28	680 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	FAM3C	Q92520	227 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	ATP2A3	Q93084	1043 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	EXOC4	Q96A65	974 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	CHFR	Q96EP1	664 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	ZNF503	Q96F45	646 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	FAM81B	Q96LP2	452 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	MED15	Q96RN5	788 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	SLC22A12	Q96S37	553 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	GKN1	Q9NS71	199 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	CISH	Q9NSE2	258 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	SCML2	Q9UQR0	700 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907		H0Y858	1186 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	LEFTY2	O00292	366 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	NFATC1	O95644	943 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	CKM	P06732	381 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	FAM200B	P0CF97	657 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	SP9	P0CG40	484 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	SETSIP	P0DME0	302 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	VDR	P11473	427 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	CCDC130	P13994	396 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	DRD1	P21728	446 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	CD72	P21854	359 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	COMT	P21964	271 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	CSF2RB	P32927	897 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	GJA4	P35212	333 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	MRE11	P49959	708 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	ZNF132	P52740	706 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	GYS2	P54840	703 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	MAP3K7CL	P57077	242 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	ZXDB	P98169	803 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	CNGA2	Q16280	664 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	FBXO43	Q4G163	708 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	HECTD3	Q5T447	861 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	ISM2	Q6H9L7	571 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	HTR3D	Q70Z44	454 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	CPA6	Q8N4T0	437 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	AMER2	Q8N7J2	671 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	FBXO32	Q969P5	355 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKAR1A-209	ENST00000585907	NT5C1B	Q96P26	610 aa		5.04	□□□□□ -1.6

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