RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579815.1

CLTC-211, Transcript of clathrin heavy chain, humanhuman

TSL 5

Gene CLTC, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTC-211ENST00000579815 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 MTBPQ96DY7 904 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 PITPNM3Q9BZ71 974 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 VPS11Q9H270 941 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 PCDH18Q9HCL0 1135 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 TXLNGQ9NUQ3 528 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 SNTG2Q9NY99 539 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 PCSK1NQ9UHG2 260 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 SNX9Q9Y5X1 595 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 RAD54BQ9Y620 910 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 IKBKGQ9Y6K9 419 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 USH1CQ9Y6N9 552 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 SCN1AP35498 2009 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 TRIP11Q15643 1979 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 A8MXQ7 604 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 B8ZZF3 427 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 HAS3O00219 553 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 DNM1LO00429 736 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 PRRG2O14669 202 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 MGRN1O60291 552 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 KPNA6O60684 536 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 EDF1O60869 148 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 DAB1O75553 588 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 GCATO75600 419 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 RECQL4O94761 1208 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 INHBAP08476 426 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 CYP2C9P11712 490 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 CCNB1P14635 433 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 CREB1P16220 341 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 WARSP23381 471 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 PAX3P23760 479 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 PRKCHP24723 683 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 CNTFP26441 200 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 LRPAP1P30533 357 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 FDFT1P37268 417 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 SERPINB9P50453 376 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 ADAM17P78536 824 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 SLC18A2Q05940 514 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 NAB1Q13506 487 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 PRSS53Q2L4Q9 553 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 KIZQ2M2Z5 673 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 SLC45A4Q5BKX6 768 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 FNBP1LQ5T0N5 605 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 ANKRD22Q5VYY1 191 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 ICE2Q659A1 982 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 TRNP1Q6NT89 227 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 PMF1Q6P1K2 205 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 ZNF449Q6P9G9 518 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 CYS1Q717R9 158 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 PRUNE1Q86TP1 453 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 ACOT1Q86TX2 421 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 SLC26A11Q86WA9 606 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 VPS52Q8N1B4 723 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 PLD5Q8N7P1 536 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 APPL2Q8NEU8 664 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 OR6B3Q8NGW1 331 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 GDAP1Q8TB36 358 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 DCAKDQ8WVC6 231 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 SLC44A1Q8WWI5 657 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 ZBTB10Q96DT7 871 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 TSPAN17Q96FV3 270 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 APOPT1Q96IL0 206 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.371e-6■■■□□ 17.2
CLTC-211ENST00000579815 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 SNX25Q9H3E2 840 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 USP29Q9HBJ7 922 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 ETNK2Q9NVF9 386 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 TMEM51Q9NW97 253 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 ACTR10Q9NZ32 417 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 MARCH2Q9P0N8 246 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 PHTF1Q9UMS5 762 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 TEX264Q9Y6I9 313 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 KPNA7A9QM74 516 aa6.47□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 KBTBD13C9JR72 458 aa6.47□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 KLF11O14901 512 aa6.47□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 KCNN4O15554 427 aa6.47□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 HUS1O60921 280 aa6.47□□□□□ -1.37
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