RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579743.2

GGA3-208, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 4

Gene GGA3, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	KNTC1	P50748	2209 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	LGALS16	A8MUM7	142 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	FFAR2	O15552	330 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	KDELR3	O43731	214 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	PIAS2	O75928	621 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	IGSF6	O95976	241 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	FER	P16591	822 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	CHRNB2	P17787	502 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	EPHB2	P29323	1055 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	ACVRL1	P37023	503 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	KLK7	P49862	253 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	PTK2B	Q14289	1009 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	MYLK3	Q32MK0	819 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	WDR59	Q6PJI9	974 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	TTC7B	Q86TV6	843 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	PDZD3	Q86UT5	571 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	ASB12	Q8WXK4	309 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	ACACA	Q13085	2346 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	CHD6	Q8TD26	2715 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	MBD3	O95983	291 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	HTR7	P34969	479 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	ABCG1	P45844	678 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	SUOX	P51687	545 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	THOP1	P52888	689 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	HDAC4	P56524	1084 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	CLDN2	P57739	230 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	RHOA	P61586	193 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	SEMG2	Q02383	582 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	GRM3	Q14832	879 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	PROX2	Q3B8N5	592 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	PARP15	Q460N3	678 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	CFAP58	Q5T655	872 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	NLRP14	Q86W24	1093 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	PARG	Q86W56	976 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	SLC25A45	Q8N413	288 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	GLMN	Q92990	594 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	DCBLD2	Q96PD2	775 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	AGPAT1	Q99943	283 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	CNPY3	Q9BT09	278 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743		A0A087WV48	116 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	IGLON5	A6NGN9	336 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	TRIM38	O00635	465 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	TOR1B	O14657	336 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	SCAMP1	O15126	338 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	CREB3	O43889	395 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	UGT2B4	P06133	528 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	GP1BA	P07359	652 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	CKMT1A	P12532	417 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	TNFAIP3	P21580	790 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	ACTN2	P35609	894 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	RPIA	P49247	311 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	RTP5	Q14D33	572 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	TMC6	Q7Z403	805 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	LSMEM2	Q8N112	164 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	CCDC185	Q8N715	623 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	PAF1	Q8N7H5	531 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		13.92	□□□□□ -0.18

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