RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570484.1

CTDNEP1-204, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTDNEP1, Length 393 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-204ENST00000570484 SDE2Q6IQ49 451 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 C22orf39Q6P5X5 142 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 PID1Q7Z2X4 250 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 UBALD2Q8IYN6 164 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 APCDD1Q8J025 514 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 BBOF1Q8ND07 529 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 CCDC110Q8TBZ0 833 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 MAML1Q92585 1016 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 RUBCNQ92622 972 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 SLCO2A1Q92959 643 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 FATE1Q969F0 183 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 RTP4Q96DX8 246 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 CHFRQ96EP1 664 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 SNF8Q96H20 258 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 SHDQ96IW2 340 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 AGAP3Q96P47 875 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 TM6SF2Q9BZW4 377 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 CEP44Q9C0F1 390 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 GBA3Q9H227 469 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 DPH5Q9H2P9 285 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 PDFQ9HBH1 243 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 ARHGEF3Q9NR81 526 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 RAB6BQ9NRW1 208 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 FBXO10Q9UK96 956 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 CA14Q9ULX7 337 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 ERVW-1Q9UQF0 538 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 HS3ST2Q9Y278 367 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 COL4A3Q01955 1670 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 C5orf60A6NFR6 353 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 NPC1O15118 1278 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 TRIM24O15164 1050 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 GCATO75600 419 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 GSRP00390 522 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 HLA-DQB2P05538 268 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 SERPINF2P08697 491 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 SRCP12931 536 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 NFKB1P19838 968 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 CES1P23141 567 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 PSMB4P28070 264 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 SLC6A11P48066 632 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 STK19P49842 368 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 TERF1P54274 439 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 GEMP55040 296 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 MAXP61244 160 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 AP1S1P61966 158 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 SARNPP82979 210 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 GUCY2DQ02846 1103 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 PRKCQQ04759 706 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 SLC10A7Q0GE19 358 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 WASHC5Q12768 1159 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 FBXO43Q4G163 708 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 SLC44A4Q53GD3 710 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 TEX44Q53QW1 395 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 ARTNQ5T4W7 220 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 IZUMO3Q5VZ72 239 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 ZNF852Q6ZMS4 543 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 Q6ZVU0 165 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 PCGF5Q86SE9 256 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 DSG4Q86SJ6 1040 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 ADIPOR2Q86V24 386 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 RNF135Q8IUD6 432 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 CHPFQ8IZ52 775 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 CYP4X1Q8N118 509 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 ZNF567Q8N184 647 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 SH2D3CQ8N5H7 860 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 FAM3CQ92520 227 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 TTC17Q96AE7 1141 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 ALG14Q96F25 216 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 IFT43Q96FT9 208 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 EXOC2Q96KP1 924 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 TEKT5Q96M29 485 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 PSKH2Q96QS6 385 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 IL12RB2Q99665 862 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 MGME1Q9BQP7 344 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 LRRC1Q9BTT6 524 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 MFSD1Q9H3U5 465 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 LRRC40Q9H9A6 602 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 ELOVL2Q9NXB9 296 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 OR51B4Q9Y5P0 310 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 V9GYY5 206 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
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