RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa17.38■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 YKT6O15498 198 aa17.38■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 AP1G1O43747 822 aa17.38■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMCC1O94876 653 aa17.38■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 RAD51Q06609 339 aa17.38■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 CA9Q16790 459 aa17.38■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC122Q5T0U0 273 aa17.38■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 HORMAD1Q86X24 394 aa17.38■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 LZTR1Q8N653 840 aa17.38■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 MFSD2AQ8NA29 543 aa17.38■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 RAB7BQ96AH8 199 aa17.38■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZWILCHQ9H900 591 aa17.38■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 IL21RQ9HBE5 538 aa17.38■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 GDF3Q9NR23 364 aa17.38■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 LCMT1Q9UIC8 334 aa17.38■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa17.38■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa17.38■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 KNL1Q8NG31 2342 aa17.38■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa17.37■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARHGAP42A6NI28 874 aa17.37■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 SH3BP5O60239 455 aa17.37■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 PCDHGA12O60330 932 aa17.37■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 IGSF6O95976 241 aa17.37■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 ADRB3P13945 408 aa17.37■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 DPYSL2Q16555 572 aa17.37■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 MYLK3Q32MK0 819 aa17.37■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 INAVAQ3KP66 663 aa17.37■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF805Q5CZA5 627 aa17.37■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa17.37■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 FBXL19Q6PCT2 694 aa17.37■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 VSTM4Q8IW00 320 aa17.37■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 OXR1Q8N573 874 aa17.37■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 TEKT4Q8WW24 435 aa17.37■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARHGEF26Q96DR7 871 aa17.37■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 NUP85Q9BW27 656 aa17.37■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa17.37■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANAPC7Q9UJX3 599 aa17.37■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 NENFQ9UMX5 172 aa17.37■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 ACTL7AQ9Y615 435 aa17.37■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 A0A1W2PQU0 124 aa17.36■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 H3BRJ5 948 aa17.36■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 MYO1FO00160 1098 aa17.36■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 TLR4O00206 839 aa17.36■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRIT1O00522 736 aa17.36■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRAMEF11O60813 436 aa17.36■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRIM16O95361 564 aa17.36■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 ERCC2P18074 760 aa17.36■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARL4AP40617 200 aa17.36■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 RHOAP61586 193 aa17.36■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 STAT4Q14765 748 aa17.36■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 GRM3Q14832 879 aa17.36■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC18A3Q16572 532 aa17.36■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 AFMIDQ63HM1 303 aa17.36■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 LAYNQ6UX15 382 aa17.36■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 GLRX5Q86SX6 157 aa17.36■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM174AQ8TBP5 190 aa17.36■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 FEM1CQ96JP0 617 aa17.36■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 CDC6Q99741 560 aa17.36■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 KLC2Q9H0B6 622 aa17.36■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 UVRAGQ9P2Y5 699 aa17.36■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa17.36■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 A0A1B0GTQ1 180 aa17.35■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 H0Y8X5 98 aa17.35■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 TSPAN6O43657 245 aa17.35■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 CBFA2T3O75081 653 aa17.35■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 PCDH8O95206 1070 aa17.35■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 WNT1P04628 370 aa17.35■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 AKT2P31751 481 aa17.35■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 GRK6P43250 576 aa17.35■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 NXPH1P58417 271 aa17.35■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 RPS21P63220 83 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 DPYSQ14117 519 aa17.35■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF284Q2VY69 593 aa17.35■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM259Q4ZIN3 620 aa17.35■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 KCNT1Q5JUK3 1230 aa17.35■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 GDPD4Q6W3E5 623 aa17.35■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 LEKR1Q6ZMV7 388 aa17.35■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM145Q8NBT3 493 aa17.35■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 RNF214Q8ND24 703 aa17.35■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 DEF6Q9H4E7 631 aa17.35■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 PDFQ9HBH1 243 aa17.35■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms