RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559192.5

USP3-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP3, Length 5,499 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-210ENST00000559192 EFHBQ8N7U6 833 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 AP5M1Q9H0R1 490 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 PCDHAC1Q9H158 963 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 PRDM12Q9H4Q4 367 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 NT5MQ9NPB1 228 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 RIC8BQ9NVN3 520 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 NENFQ9UMX5 172 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 CRYL1Q9Y2S2 319 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 NAV1Q8NEY1 1877 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 GAS2O43903 313 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 ZNF862O60290 1169 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 TCF3P15923 654 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 CDH15P55291 814 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 TP53BP2Q13625 1128 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 SCARA3Q6AZY7 606 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 LRRC49Q8IUZ0 686 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 SLC22A9Q8IVM8 553 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 OFCC1Q8IZS5 231 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 CCDC185Q8N715 623 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 LPGAT1Q92604 370 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 OR52B2Q96RD2 323 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 OLFM1Q99784 485 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 C1orf50Q9BV19 199 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 CDT1Q9H211 546 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 LHX5Q9H2C1 402 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 MYH1P12882 1939 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 AKAP11Q9UKA4 1901 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 MYH4Q9Y623 1939 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 A0A087X1B8 175 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 FAM25AB3EWG3 89 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 FAM25CB3EWG5 89 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 FAM25GB3EWG6 89 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 EDIL3O43854 480 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 MT-ND1P03886 318 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 TPSB2P20231 275 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 CHRM3P20309 590 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 NR4A1P22736 598 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 JAK1P23458 1154 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 PRKAA2P54646 552 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 SLC18A2Q05940 514 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 DGCR6Q14129 220 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 TPSAB1Q15661 275 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 METTL7BQ6UX53 244 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 GATAD2AQ86YP4 633 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 PGAM4Q8N0Y7 254 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 CHID1Q9BWS9 393 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 POPDC2Q9HBU9 364 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 EFR3BQ9Y2G0 817 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 RIPK3Q9Y572 518 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 PTPRJQ12913 1337 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 A0A088AWK7 358 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 AGRPO00253 132 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 CCDC166P0CW27 439 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 PCNAP12004 261 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 CDH3P22223 829 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 RAB10P61026 200 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 RAD51Q06609 339 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 CCNIQ14094 377 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 IL23RQ5VWK5 629 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 PRMT9Q6P2P2 845 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 NOTUMQ6P988 496 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 KLHL17Q6TDP4 642 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 C19orf18Q8NEA5 215 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 BTN2A2Q8WVV5 523 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 CLEC4DQ8WXI8 215 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 CSPG4P5Q96PW8 444 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 FIZ1Q96SL8 496 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 PKP2Q99959 881 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 SYT11Q9BT88 431 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 DNAJB4Q9UDY4 337 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 PCDHGC3Q9UN70 934 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 SLC8A2Q9UPR5 921 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 PLCH1Q4KWH8 1693 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 PDZK1P1A8MUH7 402 aa7.18□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 C2P06681 752 aa7.18□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 CCNA2P20248 432 aa7.18□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 GCAP28676 217 aa7.18□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 ABATP80404 500 aa7.18□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa7.18□□□□□ -1.26
USP3-210ENST00000559192 SH3D19Q5HYK7 790 aa7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms