RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 OR1E1P30953 314 aa16.41■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 L1CAMP32004 1257 aa16.41■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 NOS2P35228 1153 aa16.41■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 RABIFP47224 123 aa16.41■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 SLC6A3Q01959 620 aa16.41■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 MEA1Q16626 185 aa16.41■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 PTPN20Q4JDL3 420 aa16.41■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 CARD16Q5EG05 197 aa16.41■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 PRRT3Q5FWE3 981 aa16.41■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa16.41■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 DRC7Q8IY82 874 aa16.41■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 EXD3Q8N9H8 876 aa16.41■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 DCAF4L2Q8NA75 395 aa16.41■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 TBCBQ99426 244 aa16.41■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 CCDC3Q9BQI4 270 aa16.41■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 HEPHQ9BQS7 1158 aa16.41■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 ATP13A1Q9HD20 1204 aa16.41■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa16.41■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa16.41■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 CDRT15L2A8MXV6 281 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 NEMP1O14524 444 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 EFSO43281 561 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 HGFP14210 728 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 ITIH2P19823 946 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 ITGB7P26010 798 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 CXCR3P49682 368 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 PDX1P52945 283 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 ARF5P84085 180 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 SKOR1P84550 965 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 DEUP1Q05D60 604 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 TGIF1Q15583 401 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 C2CD6Q53TS8 623 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 NYAP1Q6ZVC0 841 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 VPS36Q86VN1 386 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 NETO2Q8NC67 525 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 NPY6RQ99463 290 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP16.4■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 SIRPGQ9P1W8 387 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 GULP1Q9UBP9 304 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 SALL4Q9UJQ4 1053 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 SSUH2Q9Y2M2 353 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 NAV2Q8IVL1 2488 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-227ENST00000551441 DOCK4Q8N1I0 1966 aa16.39■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 DRGXA6NNA5 263 aa16.39■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 ZMPSTE24O75844 475 aa16.39■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 ACVRL1P37023 503 aa16.39■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 CLCN6P51797 869 aa16.39■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa16.39■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 ARTNQ5T4W7 220 aa16.39■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 TRIM65Q6PJ69 517 aa16.39■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 LRRC31Q6UY01 552 aa16.39■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa16.39■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 JAMLQ86YT9 394 aa16.39■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 ARL14Q8N4G2 192 aa16.39■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 FOXP3Q9BZS1 431 aa16.39■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 CLPBQ9H078 707 aa16.39■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 EPB41L5Q9HCM4 733 aa16.39■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 SPASTQ9UBP0 616 aa16.39■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa16.39■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 BICDL2A1A5D9 508 aa16.38■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 C16orf96A6NNT2 1141 aa16.38■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 ANXA6P08133 673 aa16.38■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 KRT9P35527 623 aa16.38■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 THOP1P52888 689 aa16.38■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 PFN3P60673 137 aa16.38■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 SPIDRQ14159 915 aa16.38■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 LINC00303Q3SY05 128 aa16.38■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 RAB6CQ53S08 254 aa16.38■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 FAXCQ5TGI0 409 aa16.38■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 IGF2-ASQ6U949 168 aa16.38■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 SLC26A9Q7LBE3 791 aa16.38■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 SLC47A2Q86VL8 602 aa16.38■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 PHACTR4Q8IZ21 702 aa16.38■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 FAM174AQ8TBP5 190 aa16.38■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 LRRC61Q9BV99 259 aa16.38■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 BOCQ9BWV1 1114 aa16.38■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa16.38■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 FAM117AQ9C073 453 aa16.38■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 RAB6CQ9H0N0 254 aa16.38■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 RABGEF1Q9UJ41 708 aa16.38■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 PCDHGC3Q9UN70 934 aa16.38■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 CCDC187A0A096LP49 1063 aa16.37■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 GOLGA8SH3BPF8 625 aa16.37■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 KRIT1O00522 736 aa16.37■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 YY2O15391 372 aa16.37■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms