RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	SAP25	Q8TEE9	199 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	ASB12	Q8WXK4	309 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	LRRC19	Q9H756	370 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	SPEG	Q15772	3267 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137		A0A1W2PQU0	124 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	AREL1	O15033	823 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	CREB3	O43889	395 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	PRPSAP2	O60256	369 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	LRCH4	O75427	683 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	PROS1	P07225	676 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	ADRB3	P13945	408 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	MIP	P30301	263 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	DNA2	P51530	1060 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	TPI1	P60174	286 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	STAT4	Q14765	748 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	INAVA	Q3KP66	663 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	BOLA3	Q53S33	107 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	AFMID	Q63HM1	303 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	VPS36	Q86VN1	386 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	GATA6	Q92908	595 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	ZNF653	Q96CK0	615 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	HMCES	Q96FZ2	354 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	FEM1C	Q96JP0	617 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	TRIM7	Q9C029	511 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	KLC2	Q9H0B6	622 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	GPR27	Q9NS67	375 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	DKK3	Q9UBP4	350 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	TNFSF14	O43557	240 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	TSPAN6	O43657	245 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	BUB1	O43683	1085 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	PRAMEF11	O60813	436 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	TMCC1	O94876	653 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	GYPC	P04921	128 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	SUOX	P51687	545 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	CA9	Q16790	459 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	RFX8	Q6ZV50	586 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	LZTR1	Q8N653	840 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	IFT43	Q96FT9	208 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	PEBP4	Q96S96	227 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	PDF	Q9HBH1	243 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	IFNK	Q9P0W0	207 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	CHD6	Q8TD26	2715 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137		A0A087X0T9	212 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	KRIT1	O00522	736 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-223	ENST00000551137	PCDH8	O95206	1070 aa		11.65	□□□□□ -0.54

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