RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545688.5

SNHG1-224, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 3

Gene SNHG1, Length 610 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-224	ENST00000545688	CCDC38	Q502W7	563 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	ZNF329	Q86UD4	541 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	TMC8	Q8IU68	726 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	GPT2	Q8TD30	523 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	NLK	Q9UBE8	527 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	SMARCA4	P51532	1647 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	SLC16A5	O15375	505 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	SEPT4	O43236	478 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	MXI1	P50539	228 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	ARHGAP8	P85298	464 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	SLC39A14	Q15043	492 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	KIF19	Q2TAC6	998 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	LINS1	Q8NG48	757 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	NR4A3	Q92570	626 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	TXNDC15	Q96J42	360 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	FBXO40	Q9UH90	709 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688		A0A096LPK6	155 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	GRID2	O43424	1007 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	DCTD	P32321	178 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	GJC1	P36383	396 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	SETD9	Q8NE22	299 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	DYTN	A2CJ06	578 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	FAM157A	C9JC47	383 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	GPR12	P47775	334 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	MCM2	P49736	904 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	CUL4B	Q13620	913 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	RPE65	Q16518	533 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	ME3	Q16798	604 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	NCSTN	Q92542	709 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	IGSF21	Q96ID5	467 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	DUX5	Q96PT3	197 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688		A0A1B0GVM2	712 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	CHL1	O00533	1208 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	IL1A	P01583	271 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	CD72	P21854	359 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	TRIM14	Q14142	442 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	CCDC174	Q6PII3	467 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	RUBCN	Q92622	972 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	GAREM1	Q9H706	876 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	CHODL	Q9H9P2	273 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	TMEM51	Q9NW97	253 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	ARHGEF11	O15085	1522 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	TIMM23	O14925	209 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	HBP1	O60381	514 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	DLX5	P56178	289 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	POU5F1B	Q06416	359 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62	4e-47	■■■■■ 46.5
SNHG1-224	ENST00000545688	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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