RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545193.5

GRSF1-208, Transcript of G-rich RNA sequence binding factor 1, human

TSL 2 BASIC

Gene GRSF1, Length 2,682 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRSF1-208	ENST00000545193	ERVK-10	P10266	1014 aa		15.92	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	KRT72	Q14CN4	511 aa		15.92	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	CHI3L2	Q15782	390 aa		15.92	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	15.92	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	IRGC	Q6NXR0	463 aa		15.92	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		15.92	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		15.92	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		15.92	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	CERS2	Q96G23	380 aa		15.92	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		15.92	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	15.92	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	SEC24A	O95486	1093 aa		15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	HLA-DQB2	P05538	268 aa		15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	TPH1	P17752	444 aa		15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	CNTF	P26441	200 aa		15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	OCRL	Q01968	901 aa		15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	CDH17	Q12864	832 aa		15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	LINC00523	Q86TU6	105 aa		15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	HMCES	Q96FZ2	354 aa		15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	IL22	Q9GZX6	179 aa		15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	PSAT1	Q9Y617	370 aa		15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	MAGEB16	A2A368	324 aa		15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	ANXA9	O76027	345 aa		15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	USP1	O94782	785 aa		15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	SOD2	P04179	222 aa		15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	RFC2	P35250	354 aa		15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	NAB1	Q13506	487 aa		15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	ANO4	Q32M45	955 aa		15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	PACS1	Q6VY07	963 aa		15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	THTPA	Q9BU02	230 aa		15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	SCOC	Q9UIL1	159 aa		15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	COL4A6	Q14031	1691 aa		15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	DRGX	A6NNA5	263 aa		15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	AP3B1	O00203	1094 aa		15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	MAP3K7	O43318	606 aa		15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	CCNF	P41002	786 aa		15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	KCNQ1	P51787	676 aa		15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	AQP5	P55064	265 aa		15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	RASSF3	Q86WH2	238 aa		15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	MFSD3	Q96ES6	412 aa		15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	TTC1	Q99614	292 aa		15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	VCX	Q9H320	206 aa		15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		15.91	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	ABLIM3	O94929	683 aa		15.9	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	PEX11B	O96011	259 aa		15.9	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	FES	P07332	822 aa		15.9	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	ITGB8	P26012	769 aa		15.9	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	15.9	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	DEFB103A	P81534	67 aa		15.9	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		15.9	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		15.9	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		15.9	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	IPMK	Q8NFU5	416 aa		15.9	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		15.9	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	E2F7	Q96AV8	911 aa		15.9	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	TMEM169	Q96HH4	297 aa		15.9	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF558	Q96NG5	402 aa		15.9	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	15.9	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		15.9	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		15.9	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	WBP1L	Q9NX94	342 aa		15.9	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		15.9	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	15.9	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	MEI4	A8MW99	385 aa		15.9	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193		J3KR12	359 aa		15.9	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	BAG2	O95816	211 aa		15.9	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		15.9	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	DSG1	Q02413	1049 aa		15.9	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	15.9	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		15.9	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	15.9	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		15.9	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		15.9	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	RILP	Q96NA2	401 aa		15.9	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	EBF4	Q9BQW3	602 aa		15.9	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		15.9	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	PLLP	Q9Y342	182 aa		15.9	■□□□□ 0.14

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