RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516319.1

SNORD27.1-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 27, humanhuman

BASIC

Gene SNORD27, Length 72 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Exosome, Nucleolus, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD27.1-201ENST00000516319 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
SNORD27.1-201ENST00000516319 MVB12BQ9H7P6 319 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD27.1-201ENST00000516319 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD27.1-201ENST00000516319 HIF1ANQ9NWT6 349 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD27.1-201ENST00000516319 PCDHA7Q9UN72 937 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD27.1-201ENST00000516319 A0A096LPK6 155 aa3.41□□□□□ -1.86
SNORD27.1-201ENST00000516319 RRN3P2A6NIE6 340 aa3.41□□□□□ -1.86
SNORD27.1-201ENST00000516319 KCNAB3O43448 404 aa3.41□□□□□ -1.86
SNORD27.1-201ENST00000516319 TSPAN3O60637 253 aa3.41□□□□□ -1.86
SNORD27.1-201ENST00000516319 CHRM4P08173 479 aa3.41□□□□□ -1.86
SNORD27.1-201ENST00000516319 MMP3P08254 477 aa3.41□□□□□ -1.86
SNORD27.1-201ENST00000516319 TFPIP10646 304 aa3.41□□□□□ -1.86
SNORD27.1-201ENST00000516319 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
SNORD27.1-201ENST00000516319 CTPS1P17812 591 aa3.41□□□□□ -1.86
SNORD27.1-201ENST00000516319 ITGB8P26012 769 aa3.41□□□□□ -1.86
SNORD27.1-201ENST00000516319 TNFRSF8P28908 595 aa3.41□□□□□ -1.86
SNORD27.1-201ENST00000516319 DCTDP32321 178 aa3.41□□□□□ -1.86
SNORD27.1-201ENST00000516319 GGT5P36269 586 aa3.41□□□□□ -1.86
SNORD27.1-201ENST00000516319 MLH1P40692 756 aa3.41□□□□□ -1.86
SNORD27.1-201ENST00000516319 MAPK7Q13164 816 aa3.41□□□□□ -1.86
SNORD27.1-201ENST00000516319 MYBPC2Q14324 1141 aa3.41□□□□□ -1.86
SNORD27.1-201ENST00000516319 EDRF1Q3B7T1 1238 aa3.41□□□□□ -1.86
SNORD27.1-201ENST00000516319 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa3.41□□□□□ -1.86
SNORD27.1-201ENST00000516319 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.41□□□□□ -1.86
SNORD27.1-201ENST00000516319 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa3.41□□□□□ -1.86
SNORD27.1-201ENST00000516319 CYP26C1Q6V0L0 522 aa3.41□□□□□ -1.86
SNORD27.1-201ENST00000516319 EXOC8Q8IYI6 725 aa3.41□□□□□ -1.86
SNORD27.1-201ENST00000516319 RFWD2Q8NHY2 731 aa3.41□□□□□ -1.86
SNORD27.1-201ENST00000516319 RAB40AQ8WXH6 277 aa3.41□□□□□ -1.86
SNORD27.1-201ENST00000516319 HERVK_113Q902F9 699 aa3.41□□□□□ -1.86
SNORD27.1-201ENST00000516319 LYZL4Q96KX0 146 aa3.41□□□□□ -1.86
SNORD27.1-201ENST00000516319 MARK4Q96L34 752 aa3.41□□□□□ -1.86
SNORD27.1-201ENST00000516319 YME1L1Q96TA2 773 aa3.41□□□□□ -1.86
SNORD27.1-201ENST00000516319 CD180Q99467 661 aa3.41□□□□□ -1.86
SNORD27.1-201ENST00000516319 GPR63Q9BZJ6 419 aa3.41□□□□□ -1.86
SNORD27.1-201ENST00000516319 PLK2Q9NYY3 685 aa3.41□□□□□ -1.86
SNORD27.1-201ENST00000516319 GGA3Q9NZ52 723 aa3.41□□□□□ -1.86
SNORD27.1-201ENST00000516319 PEMTQ9UBM1 199 aa3.41□□□□□ -1.86
SNORD27.1-201ENST00000516319 FBXO40Q9UH90 709 aa3.41□□□□□ -1.86
SNORD27.1-201ENST00000516319 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
SNORD27.1-201ENST00000516319 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 LINC01553A4QN01 128 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 VWA5AO00534 786 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 IKBKBO14920 756 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 TIMM23O14925 209 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 SPTLC2O15270 562 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 PYGLP06737 847 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP3.4□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 MYZAPP0CAP1 466 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 CBSLP0DN79 551 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 HSD3B1P14060 373 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 ITGB6P18564 788 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 CBSP35520 551 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 PGM1P36871 562 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 GPR12P47775 334 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 Q0VFX4 171 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 RUNX2Q13950 521 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 WDR45BQ5MNZ6 344 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 IL20RBQ6UXL0 311 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 MON1BQ7L1V2 547 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 CPXM2Q8N436 756 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 USP38Q8NB14 1042 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 OR14A16Q8NHC5 309 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 BICD2Q8TD16 824 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 ELP4Q96EB1 424 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 MPHOSPH8Q99549 860 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 TMEM204Q9BSN7 226 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 MSTO1Q9BUK6 570 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 HEMGNQ9BXL5 484 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 TAOK3Q9H2K8 898 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 SLC2A4P14672 509 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 NAGAP17050 411 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 GNLYP22749 145 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 CCKARP32238 428 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 LIFRP42702 1097 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 KCNJ4P48050 445 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 CCT5P48643 541 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 PDLIM4P50479 330 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 NUDT6P53370 316 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 HDAC4P56524 1084 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 LTBQ06643 244 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 CHRNDQ07001 517 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 EFR3AQ14156 821 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 ERV3-1Q14264 604 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD27.1-201ENST00000516319 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms